An Isotope-coded affinity tag (ICAT) is an in-vitro isotopic labeling method used for quantitative proteomics by mass spectrometry that uses chemical labeling reagents. These chemical probes consist of three elements: a reactive group for labeling an amino acid side chain (e.g., iodoacetamide to modify cysteine residues), an isotopically coded linker, and a tag (e.g., biotin) for the affinity isolation of labeled proteins/peptides. The samples are combined and then separated through chromatography, then sent through a mass spectrometer to determine the mass-to-charge ratio between the proteins. Only cysteine containing peptides can be analysed. Since only cysteine containing peptides are analysed, often the post translational modification is lost.
| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| rdfs:label
| - Marcatge per afinitat amb codificació isotòpica (ca)
- ICAT (de)
- Etichetta di affinità codificata da isotopi (it)
- Isotope-coded affinity tag (en)
|
| rdfs:comment
| - ICAT (von englisch Isotope-coded affinity tag ‚Isotopen-codierte Affinitätsmarkierung‘) ist eine biochemische Methode für quantitative Proteinanalysen, welche sich auf eine massenspektrometrische Analyse eines Proteins anhand seiner Markierung mit einem Protein-Tag stützt, welches zuvor mit unterschiedlichen Isotopen gekoppelt wurde. (de)
- An Isotope-coded affinity tag (ICAT) is an in-vitro isotopic labeling method used for quantitative proteomics by mass spectrometry that uses chemical labeling reagents. These chemical probes consist of three elements: a reactive group for labeling an amino acid side chain (e.g., iodoacetamide to modify cysteine residues), an isotopically coded linker, and a tag (e.g., biotin) for the affinity isolation of labeled proteins/peptides. The samples are combined and then separated through chromatography, then sent through a mass spectrometer to determine the mass-to-charge ratio between the proteins. Only cysteine containing peptides can be analysed. Since only cysteine containing peptides are analysed, often the post translational modification is lost. (en)
- L'etichetta di affinità codificata da isotopi (Isotope-Coded Affinity Tag - ICAT) è un metodo di marcatura isotopica adoperato nella proteomica quantitativa tramite l'uso della spettrometria di massa. Vengono sfruttati dei reagenti marcatori (probes) composti di tre parti: un gruppo reattivo per marcare la catena laterale di uno specifico amminoacido nel campione (ad esempio lo lega i residui di cisteina), l'etichetta, in inglese tag, (come biotina) per l'isolamento delle proteine e peptidi marcati attraverso una cromatografia per affinità e una catena carboniosa che funge da legame tra il gruppo reattivo e l'etichetta e che risulta provvisto di vari siti sfruttabili per la marcatura isotopica con deuterio. (it)
- El Marcatge per afinitat amb codificació isotòpica és un mètode de basat en la utilització de sondes químiques conegudes com a ICAT. Aquestes sondes consisteixen en 3 parts funcionals principals: un grup reactiu capaç de marcar específicament la cadena lateral de determinats aminoàcids (p. e. s'utilitzen grups reactius de tipus per al marcatge dels residus de cisteïna), una regió espaiadora amb codificació isotòpica, i una etiqueta de revelat (p. e. biotina) per a l'aïllament per afinitat de les proteïnes o els pèptids marcats. Per a la comparació quantitativa de dos proteomes, la primera mostra es marca amb una sonda amb isòtops lleugers (p. e. ¹H), mentre que per al marcatge de la segona mostra s'utilitza una sonda equivalent però amb isòtops pesats (p. e. ²H). La presència d'aquests i (ca)
|
| dcterms:subject
| |
| Wikipage page ID
| |
| Wikipage revision ID
| |
| Link from a Wikipage to another Wikipage
| |
| sameAs
| |
| dbp:wikiPageUsesTemplate
| |
| has abstract
| - El Marcatge per afinitat amb codificació isotòpica és un mètode de basat en la utilització de sondes químiques conegudes com a ICAT. Aquestes sondes consisteixen en 3 parts funcionals principals: un grup reactiu capaç de marcar específicament la cadena lateral de determinats aminoàcids (p. e. s'utilitzen grups reactius de tipus per al marcatge dels residus de cisteïna), una regió espaiadora amb codificació isotòpica, i una etiqueta de revelat (p. e. biotina) per a l'aïllament per afinitat de les proteïnes o els pèptids marcats. Per a la comparació quantitativa de dos proteomes, la primera mostra es marca amb una sonda amb isòtops lleugers (p. e. ¹H), mentre que per al marcatge de la segona mostra s'utilitza una sonda equivalent però amb isòtops pesats (p. e. ²H). La presència d'aquests isòtops provoca una diferència de massa en les sondes utilitzades que posteriorment permet distingir els pèptids provinents d'una i altra mostra. Per minimitzar els errors quantitatius, ambdues mostres, un cop marcades, es combinen, es digereixen amb una proteasa (p. e. tripsina) i se sotmeten a una per aïllar els pèptids marcats amb les sondes pertinents. Finalment, els pèptids s'analitzen per cromatografia líquida acoblada a espectrometria de masses (LC-MS) i s'utilitza la relació entre les intensitats del senyal de cada parella de pèptids per a la quantificació relativa de les proteïnes presents en les dues mostres d'interès. (ca)
- ICAT (von englisch Isotope-coded affinity tag ‚Isotopen-codierte Affinitätsmarkierung‘) ist eine biochemische Methode für quantitative Proteinanalysen, welche sich auf eine massenspektrometrische Analyse eines Proteins anhand seiner Markierung mit einem Protein-Tag stützt, welches zuvor mit unterschiedlichen Isotopen gekoppelt wurde. (de)
- An Isotope-coded affinity tag (ICAT) is an in-vitro isotopic labeling method used for quantitative proteomics by mass spectrometry that uses chemical labeling reagents. These chemical probes consist of three elements: a reactive group for labeling an amino acid side chain (e.g., iodoacetamide to modify cysteine residues), an isotopically coded linker, and a tag (e.g., biotin) for the affinity isolation of labeled proteins/peptides. The samples are combined and then separated through chromatography, then sent through a mass spectrometer to determine the mass-to-charge ratio between the proteins. Only cysteine containing peptides can be analysed. Since only cysteine containing peptides are analysed, often the post translational modification is lost. (en)
- L'etichetta di affinità codificata da isotopi (Isotope-Coded Affinity Tag - ICAT) è un metodo di marcatura isotopica adoperato nella proteomica quantitativa tramite l'uso della spettrometria di massa. Vengono sfruttati dei reagenti marcatori (probes) composti di tre parti: un gruppo reattivo per marcare la catena laterale di uno specifico amminoacido nel campione (ad esempio lo lega i residui di cisteina), l'etichetta, in inglese tag, (come biotina) per l'isolamento delle proteine e peptidi marcati attraverso una cromatografia per affinità e una catena carboniosa che funge da legame tra il gruppo reattivo e l'etichetta e che risulta provvisto di vari siti sfruttabili per la marcatura isotopica con deuterio. (it)
|
| gold:hypernym
| |
| prov:wasDerivedFrom
| |
| page length (characters) of wiki page
| |
| foaf:isPrimaryTopicOf
| |
| is Link from a Wikipage to another Wikipage
of | |
| is Wikipage redirect
of | |
| is Wikipage disambiguates
of | |
| is foaf:primaryTopic
of | |
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)