About: Coronavirus packaging signal     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : dbo:MilitaryUnit, within Data Space : dbpedia.org associated with source document(s)
QRcode icon
http://dbpedia.org/describe/?url=http%3A%2F%2Fdbpedia.org%2Fresource%2FCoronavirus_packaging_signal&graph=http%3A%2F%2Fdbpedia.org&graph=http%3A%2F%2Fdbpedia.org

The Coronavirus packaging signal is a conserved cis-regulatory element found in Betacoronavirus (part of the Coronavirus subfamily of viruses). It has an important role in regulating the packaging of the viral genome into the capsid. As part of the viral life cycle, within the infected cell, the viral genome becomes associated with viral proteins and assembles into new infective progeny viruses. This process is called packaging and is vital for viral replication.

AttributesValues
rdf:type
rdfs:label
  • Coronavirus packaging signal (en)
  • إشارة تغليف فيروس كورونا (ar)
rdfs:comment
  • إشارة تغليف أو تجميع أو تعبئة فيروس كورونا (بالإنجليزية: Coronavirus packaging signal)‏ هي محفوظ يتواجد في فيروسات كورونا بيتا (وهي جنس من عائلة فيروسات كورونا)، ولها دور مهم في تنظيم تعبئة الجينوم الفيروسي داخل القفيصة. كجزء من دورة حياة الفيروس داخل الخلية المصابة، يصبح الجينوم مرتبطا ببروتينات فيروسية ويتجمع إلى فيروسات نسلية جديدة معدية. تسمى هذه العملية بالتغليف والتعبئة وهي أساسية لتضاعف الفيروس. توجد إشارة التغليف في جينوم الرنا مفرد السلسلة موجب الدلالة، وتتآثر مع بروتيني الغشاء والقفيصة النووية لضمان التغليف الانتقائي للرنا الفيروسي إلى فيرونات جديدة. (ar)
  • The Coronavirus packaging signal is a conserved cis-regulatory element found in Betacoronavirus (part of the Coronavirus subfamily of viruses). It has an important role in regulating the packaging of the viral genome into the capsid. As part of the viral life cycle, within the infected cell, the viral genome becomes associated with viral proteins and assembles into new infective progeny viruses. This process is called packaging and is vital for viral replication. (en)
name
  • Coronavirus packaging signal (en)
foaf:depiction
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/RF00182_consensus_secondary_structure.png
dcterms:subject
Wikipage page ID
Wikipage revision ID
Link from a Wikipage to another Wikipage
sameAs
Tax domain
  • Viruses (en)
dbp:wikiPageUsesTemplate
thumbnail
caption
  • Predicted secondary structure and sequence conservation of Corona_package (en)
id
  • RF00182 (en)
symbol
  • Corona_package (en)
has abstract
  • إشارة تغليف أو تجميع أو تعبئة فيروس كورونا (بالإنجليزية: Coronavirus packaging signal)‏ هي محفوظ يتواجد في فيروسات كورونا بيتا (وهي جنس من عائلة فيروسات كورونا)، ولها دور مهم في تنظيم تعبئة الجينوم الفيروسي داخل القفيصة. كجزء من دورة حياة الفيروس داخل الخلية المصابة، يصبح الجينوم مرتبطا ببروتينات فيروسية ويتجمع إلى فيروسات نسلية جديدة معدية. تسمى هذه العملية بالتغليف والتعبئة وهي أساسية لتضاعف الفيروس. توجد إشارة التغليف في جينوم الرنا مفرد السلسلة موجب الدلالة، وتتآثر مع بروتيني الغشاء والقفيصة النووية لضمان التغليف الانتقائي للرنا الفيروسي إلى فيرونات جديدة. عنصر الرنا هذا منحفظ في فيروسات (Embecovirus) (المعروفة سابقا بالنسب A من فيروسات كورونا بيتا) والتي تشمل فيروس كورونا الفأري، فيروس كورونا البقري، وفيروسات كورونا البشرية مثل: كوف-HKU1 وكوف-OC43. هذا العنصر غائب في الأنساب الفيروسية الأخرى التي طوَّرت إشارات تغليف مختلفة، وعلى سبيل المثال هو غير متواجد في سارس-كوف وسارس-كوف-2 (خلافا لبعض الادعاءات التي تم إثبات خطئها). تملك إشارة التغليف بنية رنا ثانوية منحفظة تتميز بأربع أنماط حلقات داخلية تسلسلها AGC/GUAAU. داخل الجينوم الفيروسي تتواجد إشارة التغليف في البروتين اللابنيوي 15 وتشفر عديد ببتيد يتواجد على سطح البروتين اللابنيوي 15. يؤدي حذف إشارة التغليف أو إحداث طفرات تُخل ببنيتها الثانوية ولا تخل بتشفيرها للببتيد إلى فقدان اختصاصها بوظيفة التغليف. في نفس الوقت، نقل إشارة التوجيه إلى مكان آخر من الجينوم لم يُحدث تأثيرا سلبيا على تغليف الفيروس. (ar)
  • The Coronavirus packaging signal is a conserved cis-regulatory element found in Betacoronavirus (part of the Coronavirus subfamily of viruses). It has an important role in regulating the packaging of the viral genome into the capsid. As part of the viral life cycle, within the infected cell, the viral genome becomes associated with viral proteins and assembles into new infective progeny viruses. This process is called packaging and is vital for viral replication. The packaging signal is found in the positive-sense single-stranded RNA genome. It interacts with the viral proteins (M and N) and ensures the selective packaging of viral RNA into virions. This RNA element is conserved in Embecovirus (previously known as lineage A Betacoronavirus), which includes mouse hepatitis virus (MHV), bovine coronavirus (BCoV), and human coronaviruses like HCoV-HKU1 and HCoV-OC43. Notably, this element is absent from the other viral lineages which have evolved separate packaging signals. For example, it is not found in SARS-CoV and SARS-CoV-2 (contrary to previous claims that have been refuted). The packaging signal has a conserved RNA secondary structure featuring four AGC/GUAAU internal loop motifs. Within the viral genome the packaging signal is located in the nonstructural protein 15 (nsp15) and encodes a polypeptide which is found on the surface of the nsp15 protein. Deleting the packaging signal or introducing mutations that disrupt its secondary structure but not the encoded peptide lead to the loss of packaging specificity. At the same time, relocating the packaging signal to a different part of the genome did not have a negative effect on packaging. Other RNA families identified in the coronavirus include the coronavirus frameshifting stimulation element, the coronavirus 3′ stem-loop II-like motif (s2m), as well as the 5′- and 3′ UTR pseudoknot. (en)
Rfam
  • RF00182 (en)
RNA type
gold:hypernym
prov:wasDerivedFrom
page length (characters) of wiki page
foaf:isPrimaryTopicOf
is Link from a Wikipage to another Wikipage of
is Wikipage disambiguates of
is foaf:primaryTopic of
Faceted Search & Find service v1.17_git139 as of Feb 29 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 08.03.3330 as of Mar 19 2024, on Linux (x86_64-generic-linux-glibc212), Single-Server Edition (62 GB total memory, 43 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software