About: Coronavirus frameshifting stimulation element     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : yago:PsychologicalFeature100023100, within Data Space : dbpedia.org associated with source document(s)
QRcode icon
http://dbpedia.org/describe/?url=http%3A%2F%2Fdbpedia.org%2Fresource%2FCoronavirus_frameshifting_stimulation_element&graph=http%3A%2F%2Fdbpedia.org&graph=http%3A%2F%2Fdbpedia.org

In molecular biology, the coronavirus frameshifting stimulation element is a conserved stem-loop of RNA found in coronaviruses that can promote ribosomal frameshifting. Such RNA molecules interact with a downstream region to form a pseudoknot structure; the region varies according to the virus but pseudoknot formation is known to stimulate frameshifting. In the classical situation, a sequence 32 nucleotides downstream of the stem is complementary to part of the loop. In other coronaviruses, however, another stem-loop structure around 150 nucleotides downstream can interact with members of this family to form kissing stem-loops and stimulate frameshifting.

AttributesValues
rdf:type
rdfs:label
  • Coronavirus frameshifting stimulation element (en)
  • عنصر تحفيز انزياح الإطار لفيروس كورونا (ar)
rdfs:comment
  • عنصر تحفيز انزياح الإطار الخاص بفيروس كورونا (بالإنجليزية: Coronavirus frameshifting stimulation element)‏ هي حلقة جذعية منحفظة للرنا تتواجد في فيروسات كورونا ويمكنها تحفيز انزياح الإطار الريبوسومي. تتآثر بنى الرنا هذه مع منطقة مع الاتجاه لتشكيل بنية عقدة كاذبة، تختلف المنطقة تبعا للفيروس لكن من المعروف أن تكوُّن العقدة الكاذبة يحث على انزياح الإطار. في الحالة الكلاسيكية، يكون تسلسلٌ طوله 32 نوكليوتيد مع الاتجاه بالنسبة للجذع مكملا لجزء من الحلقة. في فيروسات كورونا أخرى، يمكن أن تتآثر حلقة جذعية أخرى مع الاتجاه طولها حوالي 150 نوكليوتيد مع أفراد من هذه العائلة لتشكيل . (ar)
  • In molecular biology, the coronavirus frameshifting stimulation element is a conserved stem-loop of RNA found in coronaviruses that can promote ribosomal frameshifting. Such RNA molecules interact with a downstream region to form a pseudoknot structure; the region varies according to the virus but pseudoknot formation is known to stimulate frameshifting. In the classical situation, a sequence 32 nucleotides downstream of the stem is complementary to part of the loop. In other coronaviruses, however, another stem-loop structure around 150 nucleotides downstream can interact with members of this family to form kissing stem-loops and stimulate frameshifting. (en)
name
  • Coronavirus frameshifting stimulation element (en)
foaf:depiction
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/RF00507-rscape.svg
dcterms:subject
Wikipage page ID
Wikipage revision ID
Link from a Wikipage to another Wikipage
sameAs
Tax domain
  • Viruses (en)
dbp:wikiPageUsesTemplate
thumbnail
caption
  • Predicted secondary structure and sequence conservation of Corona_FSE (en)
id
  • RF00507 (en)
symbol
  • Corona_FSE (en)
has abstract
  • عنصر تحفيز انزياح الإطار الخاص بفيروس كورونا (بالإنجليزية: Coronavirus frameshifting stimulation element)‏ هي حلقة جذعية منحفظة للرنا تتواجد في فيروسات كورونا ويمكنها تحفيز انزياح الإطار الريبوسومي. تتآثر بنى الرنا هذه مع منطقة مع الاتجاه لتشكيل بنية عقدة كاذبة، تختلف المنطقة تبعا للفيروس لكن من المعروف أن تكوُّن العقدة الكاذبة يحث على انزياح الإطار. في الحالة الكلاسيكية، يكون تسلسلٌ طوله 32 نوكليوتيد مع الاتجاه بالنسبة للجذع مكملا لجزء من الحلقة. في فيروسات كورونا أخرى، يمكن أن تتآثر حلقة جذعية أخرى مع الاتجاه طولها حوالي 150 نوكليوتيد مع أفراد من هذه العائلة لتشكيل . من عائلات الرنا الأخرى التي تم تحديدها في فيروسات كورونا: النمط المماثل للحلقة الجذعية 2 لمغم 3' لفيروس كورونا (s2m)، إشارة تجميع فيروس كورونا والعقدة الكاذبة لمغم 3' لفيروس كورونا. (ar)
  • In molecular biology, the coronavirus frameshifting stimulation element is a conserved stem-loop of RNA found in coronaviruses that can promote ribosomal frameshifting. Such RNA molecules interact with a downstream region to form a pseudoknot structure; the region varies according to the virus but pseudoknot formation is known to stimulate frameshifting. In the classical situation, a sequence 32 nucleotides downstream of the stem is complementary to part of the loop. In other coronaviruses, however, another stem-loop structure around 150 nucleotides downstream can interact with members of this family to form kissing stem-loops and stimulate frameshifting. Other RNA families identified in the coronavirus include the coronavirus 3′ stem-loop II-like motif (s2m), the coronavirus packaging signal and the coronavirus 3′ UTR pseudoknot. During protein synthesis, rapidly changing conditions in the cell can cause ribosomal pausing. In coronaviruses, this can affect growth rate and trigger translational abandonment. This releases the ribosome from the mRNA and the incomplete polypeptide is targeted for destruction. (en)
Rfam
  • RF00507 (en)
RNA type
prov:wasDerivedFrom
page length (characters) of wiki page
foaf:isPrimaryTopicOf
is Link from a Wikipage to another Wikipage of
is foaf:primaryTopic of
Faceted Search & Find service v1.17_git139 as of Feb 29 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 08.03.3330 as of Mar 19 2024, on Linux (x86_64-generic-linux-glibc212), Single-Server Edition (61 GB total memory, 42 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software