About: Coronavirus 3′ stem-loop II-like motif (s2m)     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : owl:Thing, within Data Space : dbpedia.org associated with source document(s)
QRcode icon
http://dbpedia.org/describe/?url=http%3A%2F%2Fdbpedia.org%2Fresource%2FCoronavirus_3%E2%80%B2_stem-loop_II-like_motif_%28s2m%29&graph=http%3A%2F%2Fdbpedia.org&graph=http%3A%2F%2Fdbpedia.org

The Coronavirus 3′ stem-loop II-like motif (also known as s2m) is a secondary structure motif identified in the 3′ untranslated region (3′UTR) of astrovirus, coronavirus and equine rhinovirus genomes. Its function is unknown, but various viral 3′ UTR regions have been found to play roles in viral replication and packaging. Other RNA families identified in the coronavirus include the coronavirus frameshifting stimulation element, the coronavirus packaging signal and the coronavirus 3′ UTR pseudoknot.

AttributesValues
rdfs:label
  • نمط مماثل للحلقة الجذعية 2 لمغم 3' لفيروس كورونا (ar)
  • Coronavirus 3′ stem-loop II-like motif (s2m) (en)
rdfs:comment
  • نمط مماثل للحلقة الجذعية 2 لمغم 3' لفيروس كورونا (بالإنجليزية: Coronavirus 3′ stem-loop II-like motif)‏ ويُعرف كذلك بـ(s2m) هو هيئة ونمط من أنماط البنية الثانوية للرنا تم تحديده في المنطقة غير المترجمة 3' الخاصة بجينومات الفيروسات النجمية وفيروسات كورونا والفيروسات الأنفية الخيلية.، وظيفته غير معروفة لكن وُجد أن العديد من المناطق غير المترجمة 3' تلعب دورا في تضاعف وتعبئة الفيروس. من عائلات الرنا الأخرى التي تم تحديدها في فيروسات كورونا: عنصر تحفيز انزياح الإطار لفيروس كورونا، إشارة تجميع فيروس كورونا والعقدة الكاذبة لمغم 3' لفيروس كورونا. (ar)
  • The Coronavirus 3′ stem-loop II-like motif (also known as s2m) is a secondary structure motif identified in the 3′ untranslated region (3′UTR) of astrovirus, coronavirus and equine rhinovirus genomes. Its function is unknown, but various viral 3′ UTR regions have been found to play roles in viral replication and packaging. Other RNA families identified in the coronavirus include the coronavirus frameshifting stimulation element, the coronavirus packaging signal and the coronavirus 3′ UTR pseudoknot. (en)
name
  • Coronavirus 3′ stem-loop II-like motif (en)
foaf:depiction
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/PDB_1xjr_EBI.png
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/RF00164-rscape.svg
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/S2m_structure_of_SARS-CoV.png
dcterms:subject
Wikipage page ID
Wikipage revision ID
Link from a Wikipage to another Wikipage
Link from a Wikipage to an external page
sameAs
Tax domain
  • Eukaryota; Viruses (en)
dbp:wikiPageUsesTemplate
thumbnail
caption
id
  • RF00164 (en)
symbol
has abstract
  • نمط مماثل للحلقة الجذعية 2 لمغم 3' لفيروس كورونا (بالإنجليزية: Coronavirus 3′ stem-loop II-like motif)‏ ويُعرف كذلك بـ(s2m) هو هيئة ونمط من أنماط البنية الثانوية للرنا تم تحديده في المنطقة غير المترجمة 3' الخاصة بجينومات الفيروسات النجمية وفيروسات كورونا والفيروسات الأنفية الخيلية.، وظيفته غير معروفة لكن وُجد أن العديد من المناطق غير المترجمة 3' تلعب دورا في تضاعف وتعبئة الفيروس. يبدو أن هذا النمط منحفط على كلا المستويين تسلسل النوكليوتيدات وبنية التطوي الثانوية ما يوحي باصطفاء تطوري قوي لانحفاظه. تواجد هذا النمط المحفوظ في مختلف العائلات الفيروسية يوحي بأنه كان نتيجة حادثتي تأشيب منفصلتين على الأقل. حتى اليوم، وُصف s2m في أربع عائلات فيروسات رنا مفردة السلسلة موجبة الدلالة: النجمية والكأسية والبيكورناوية وكورونا. يمكن للفيروسات التي تحتوي s2m إصابة مجموعة واسعة من الفقاريات العليا مثل: الطيور، الخفافيش، الأحصنة، الكلاب والبشر، وتبدي انتحاءات نسيجية متنوعة. يبدو أن هنالك نديد أجنبي في أنواعٍ من الحشرات ذات الصلة البعيدة. من عائلات الرنا الأخرى التي تم تحديدها في فيروسات كورونا: عنصر تحفيز انزياح الإطار لفيروس كورونا، إشارة تجميع فيروس كورونا والعقدة الكاذبة لمغم 3' لفيروس كورونا. (ar)
  • The Coronavirus 3′ stem-loop II-like motif (also known as s2m) is a secondary structure motif identified in the 3′ untranslated region (3′UTR) of astrovirus, coronavirus and equine rhinovirus genomes. Its function is unknown, but various viral 3′ UTR regions have been found to play roles in viral replication and packaging. This motif appears to be conserved in both nucleotide sequence and secondary structure folding indicating a strong evolutionary selection for its conservation. The presence of this conserved motif in different viral families is suggested to be the result of at least two separate recombination events. To date s2m has been described in four families of positive sense single-stranded RNA viruses; Astroviridae, Caliciviridae, Picornaviridae and Coronaviridae. The viruses that contain s2m can infect a wide range of higher vertebrates, including birds, bats, horses, dogs and humans, and display different tissue tropisms. There seems to be a xenologue of s2m in a number of only distantly related insect species. Other RNA families identified in the coronavirus include the coronavirus frameshifting stimulation element, the coronavirus packaging signal and the coronavirus 3′ UTR pseudoknot. (en)
Rfam
  • RF00164 (en)
RNA type
prov:wasDerivedFrom
page length (characters) of wiki page
foaf:isPrimaryTopicOf
is Link from a Wikipage to another Wikipage of
is Wikipage redirect of
is foaf:primaryTopic of
Faceted Search & Find service v1.17_git139 as of Feb 29 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 08.03.3330 as of Mar 19 2024, on Linux (x86_64-generic-linux-glibc212), Single-Server Edition (61 GB total memory, 42 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software