A contig (from contiguous) is a set of overlapping DNA segments that together represent a consensus region of DNA.In bottom-up sequencing projects, a contig refers to overlapping sequence data (reads); in top-down sequencing projects, contig refers to the overlapping clones that form a physical map of the genome that is used to guide sequencing and assembly. Contigs can thus refer both to overlapping DNA sequences and to overlapping physical segments (fragments) contained in clones depending on the context.
| Attributes | Values |
|---|
| rdfs:label
| - Contig (en)
- Còntig (ca)
- Contig (de)
- Cóntigo (es)
- Contig (fr)
- コンティグ (ja)
- Контиг (ru)
- Contig (sv)
- Контиг (uk)
|
| rdfs:comment
| - Un còntig és un fragment llarg d'ADN producte de l'assemblatge de seqüències més curtes mitjançant eines bioinformàtiques. (ca)
- Ein Contig (von engl. contiguous = angrenzend, zusammenhängend) ist ein Satz überlappender DNA- oder Protein-Stücke (reads), die von derselben genetischen Quelle stammen. Ein solches Contig kann dazu genutzt werden, die Original-DNA-Sequenz dieser genetischen Quelle (z. B. die Sequenz eines Chromosoms) abzuleiten. Eine Contig-Karte zeigt die relative Reihenfolge einer zusammengehörenden Contig-Bibliothek, die z. B. ein komplettes Chromosom darstellen. (de)
- A contig (from contiguous) is a set of overlapping DNA segments that together represent a consensus region of DNA.In bottom-up sequencing projects, a contig refers to overlapping sequence data (reads); in top-down sequencing projects, contig refers to the overlapping clones that form a physical map of the genome that is used to guide sequencing and assembly. Contigs can thus refer both to overlapping DNA sequences and to overlapping physical segments (fragments) contained in clones depending on the context. (en)
- Un contig est une séquence génomique continue et ordonnée générée par l'assemblage des clones d'une (sous forme de plasmides, cosmides, BAC ou YAC) qui se chevauchent.
* Portail de la biologie (fr)
- コンティグ（Contig）は、DNA配列断片群を重ね合わせ(シーケンスアライメント)して できるコンセンサス配列や、それを構成する配列断片群のことを指す、ゲノミクス分野における用語である 。英単語の'contiguous'に由来している('continuous'ではないことに注意)。 この用語には、大きく分けて２つの意味合いがある。ひとつは、ボトムアップのシークエンシングプロジェクトにおけるものであり、この方法ではによって得られた短い配列断片(read)をアセンブルすることによって、リード末端が連続的に重なり合うように伸長された配列群を情報処理的に得ることができ、この大きな配列断片のことをコンティグと呼ぶ。一方でトップダウンのシークエンシングプロジェクトにおいては、生物が持つ長大なゲノム配列の全体を遺伝子地図のレベルの大きな長さ単位で端が重複するように物理的にせん断するが、この部分的に重複したゲノムクローンの断片のことをコンティグと呼称する。すなわちコンティグとは、リードの重ね合わせと伸長から得られる大きなDNA断片配列と、染色体ゲノムの物理的なせん断から得られる部分的に重複したクローンDNA、の両方を指す用語となっている。 (ja)
- Ett contig (från contiguous) är en samling överlappande DNA-segment som kommer från en enda genetisk källa. Dessa uppstår vid shotgun-sekvensering av DNA. En contig kan användas för att sammanställa den ursprungliga DNA-sekvensen hos källan. En contig-karta visar den relativa ordningen hos contiger i ett sammanlänkat contig-bibliotek, som representerar ett kromosomsegment. Denna genetikrelaterade artikel saknar väsentlig information. Du kan hjälpa till genom att lägga till den. (sv)
- Контиг (від англ. contiguous) — набір сегментів ДНК, що перекриваються, які в сукупності являють собою консенсусну ділянку ДНК. У задачі складання геному контиги — це довгі ділянки ДНК (рядки з нуклеотидів), отримані в процесі складання. (uk)
- Контиг (от англ. contiguous) представляет собой набор перекрывающихся сегментов ДНК, которые в совокупности представляют собой консенсусную область ДНК. В задаче сборки генома контиги представляют собой продолжительные участки ДНК (строки из нуклеотидов), полученные в процессе сборки. (ru)
- Un Cóntigo, en inglés Contig (de contiguous), son segmentos de ADN superpuestos, que juntos representan una región consenso de ADN. En la secuenciación de "abajo arriba", un cóntigo refiere a la superposición de datos en la secuencia, en la secuenciación de "arriba abajo", refiere a los clones superpuestos que forman un mapa físico del genoma utilizado para guiar la secuenciación y ensamblaje de este. Dependiendo del contexto, cóntigo puede referir tanto a la superposición de secuencia de ADN, como a la superposición de segmentos físicos (fragmentos) contenidos en los clones. (es)
|
| foaf:depiction
| |
| dcterms:subject
| |
| Wikipage page ID
| |
| Wikipage revision ID
| |
| Link from a Wikipage to another Wikipage
| |
| Link from a Wikipage to an external page
| |
| sameAs
| |
| dbp:wikiPageUsesTemplate
| |
| thumbnail
| |
| has abstract
| - Un còntig és un fragment llarg d'ADN producte de l'assemblatge de seqüències més curtes mitjançant eines bioinformàtiques. (ca)
- Ein Contig (von engl. contiguous = angrenzend, zusammenhängend) ist ein Satz überlappender DNA- oder Protein-Stücke (reads), die von derselben genetischen Quelle stammen. Ein solches Contig kann dazu genutzt werden, die Original-DNA-Sequenz dieser genetischen Quelle (z. B. die Sequenz eines Chromosoms) abzuleiten. Eine Contig-Karte zeigt die relative Reihenfolge einer zusammengehörenden Contig-Bibliothek, die z. B. ein komplettes Chromosom darstellen. (de)
- A contig (from contiguous) is a set of overlapping DNA segments that together represent a consensus region of DNA.In bottom-up sequencing projects, a contig refers to overlapping sequence data (reads); in top-down sequencing projects, contig refers to the overlapping clones that form a physical map of the genome that is used to guide sequencing and assembly. Contigs can thus refer both to overlapping DNA sequences and to overlapping physical segments (fragments) contained in clones depending on the context. (en)
- Un Cóntigo, en inglés Contig (de contiguous), son segmentos de ADN superpuestos, que juntos representan una región consenso de ADN. En la secuenciación de "abajo arriba", un cóntigo refiere a la superposición de datos en la secuencia, en la secuenciación de "arriba abajo", refiere a los clones superpuestos que forman un mapa físico del genoma utilizado para guiar la secuenciación y ensamblaje de este. Dependiendo del contexto, cóntigo puede referir tanto a la superposición de secuencia de ADN, como a la superposición de segmentos físicos (fragmentos) contenidos en los clones. La construcción física del mapa del ADN a menudo incluye el aislamiento de grandes fragmentos de ADN en clones, como los YAC y los BAC. Estos clones se analizan para determinar cuáles contienen ADN en común, o en otras palabras cuales están superpuestos. Estos clones contiguos constituyen un contig o cóntigo donde los clones adyacentes tienen en común parte de su secuencia. Los "contigs" son importantes porque brindan la posibilidad de estudiar un segmento del genoma completo especialmente cuando se buscan genes con ciertas características y cuando se desea establecer la secuencia de grandes fragmentos de un cromosoma. (es)
- Un contig est une séquence génomique continue et ordonnée générée par l'assemblage des clones d'une (sous forme de plasmides, cosmides, BAC ou YAC) qui se chevauchent.
* Portail de la biologie (fr)
- コンティグ（Contig）は、DNA配列断片群を重ね合わせ(シーケンスアライメント)して できるコンセンサス配列や、それを構成する配列断片群のことを指す、ゲノミクス分野における用語である 。英単語の'contiguous'に由来している('continuous'ではないことに注意)。 この用語には、大きく分けて２つの意味合いがある。ひとつは、ボトムアップのシークエンシングプロジェクトにおけるものであり、この方法ではによって得られた短い配列断片(read)をアセンブルすることによって、リード末端が連続的に重なり合うように伸長された配列群を情報処理的に得ることができ、この大きな配列断片のことをコンティグと呼ぶ。一方でトップダウンのシークエンシングプロジェクトにおいては、生物が持つ長大なゲノム配列の全体を遺伝子地図のレベルの大きな長さ単位で端が重複するように物理的にせん断するが、この部分的に重複したゲノムクローンの断片のことをコンティグと呼称する。すなわちコンティグとは、リードの重ね合わせと伸長から得られる大きなDNA断片配列と、染色体ゲノムの物理的なせん断から得られる部分的に重複したクローンDNA、の両方を指す用語となっている。 (ja)
- Ett contig (från contiguous) är en samling överlappande DNA-segment som kommer från en enda genetisk källa. Dessa uppstår vid shotgun-sekvensering av DNA. En contig kan användas för att sammanställa den ursprungliga DNA-sekvensen hos källan. En contig-karta visar den relativa ordningen hos contiger i ett sammanlänkat contig-bibliotek, som representerar ett kromosomsegment. Denna genetikrelaterade artikel saknar väsentlig information. Du kan hjälpa till genom att lägga till den. (sv)
- Контиг (від англ. contiguous) — набір сегментів ДНК, що перекриваються, які в сукупності являють собою консенсусну ділянку ДНК. У задачі складання геному контиги — це довгі ділянки ДНК (рядки з нуклеотидів), отримані в процесі складання. (uk)
- Контиг (от англ. contiguous) представляет собой набор перекрывающихся сегментов ДНК, которые в совокупности представляют собой консенсусную область ДНК. В задаче сборки генома контиги представляют собой продолжительные участки ДНК (строки из нуклеотидов), полученные в процессе сборки. (ru)
|
| gold:hypernym
| |
| prov:wasDerivedFrom
| |
| page length (characters) of wiki page
| |
| foaf:isPrimaryTopicOf
| |
| is Link from a Wikipage to another Wikipage
of | |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)
