A Chip description file is a file that contains a possible annotation of a microarray chip type. The file typically specifies which probes map to the same genomic unit of interest. This mapping methodology solves the problem of a reliable reconstruction of expression levels as, if more than one probeset per gene exists, expression signals for the same transcript may be enhanced incorrectly.
| Attributes | Values |
|---|
| rdfs:label
| - ملف وصف الرقاقة (ar)
- Chip description file (en)
|
| rdfs:comment
| - ملف وصف الرقاقة هو ملف يحتوي على شروحات محتملة لرقاقة من نوع مصفوفة مجهرية. هذا الملف يحدد أي ذبذبات تنتمي إلى وحدة الجينوم المعنية. هذه الطريقة تحل مشكلة وجود إعادة بناء مستويات الإبانة؛ مثل وجود أكثر من مجموعة ذبذبات واحدة للجين، إشارات إبانة لنفس النسخة من الممكن أن يتم زيادتها بشكل خاطئ. (ar)
- A Chip description file is a file that contains a possible annotation of a microarray chip type. The file typically specifies which probes map to the same genomic unit of interest. This mapping methodology solves the problem of a reliable reconstruction of expression levels as, if more than one probeset per gene exists, expression signals for the same transcript may be enhanced incorrectly. (en)
|
| dcterms:subject
| |
| Wikipage page ID
| |
| Wikipage revision ID
| |
| Link from a Wikipage to another Wikipage
| |
| sameAs
| |
| dbp:wikiPageUsesTemplate
| |
| has abstract
| - ملف وصف الرقاقة هو ملف يحتوي على شروحات محتملة لرقاقة من نوع مصفوفة مجهرية. هذا الملف يحدد أي ذبذبات تنتمي إلى وحدة الجينوم المعنية. هذه الطريقة تحل مشكلة وجود إعادة بناء مستويات الإبانة؛ مثل وجود أكثر من مجموعة ذبذبات واحدة للجين، إشارات إبانة لنفس النسخة من الممكن أن يتم زيادتها بشكل خاطئ. الوحدات الجينية المعنية يمكن أن تكون: إبانة، تنميط جيني، تسلسل مخصص، نسخ رقم و/أو وسم مجموعة ذبذبات. جميع أسماء مجموعات الذبذبات في أي مصفوفة تكون فريدة. أكثر من نسخة من مجموعة ذبذبات يمكن أن تتواجد على مصفوفة واحدة ما دام كل منها يحمل اسم فريد خاص به. ملفات وصف الرقاقة موجودة لإبانة الجينات (ربط مجموعات الذبذبات مع الجينات)، وللتنميط الجيني (ربط مجموعة ذبذبات مع النيوكليوتيد الوحيد متعدد الأشكال ونوع الأليل). يمكن أن يتواجد ملفات وصف رقاقة مختلفة لنوع رقاقة واحد؛ أحدهم يمكن أن يستخدم ليعمل على (فحص) النسخ الجينية وآخر يعمل على (فحص) الإكسونات. في البداية، قامت شركة أفيمتركس (Affymetrix) بإنشاء التخصيص لوصف التصميم لمصفوفة رقاقة جين أفيمتركس. لا زالت أفيمتركس تقدم ملفات وصف رقاقة رسمية لغالبية أنواع الرقاقات الخاصة بها. بالإضافة إلى ذلك، مختلف المجموعات تقدم ملفات وصف رقاقة مخصصة والمصممة لمختلف الخصائص الجينومية. ملفات وصف الرقاقة يتم تحديثها عندما يتم تحديث شروحات الجينوم. (ar)
- A Chip description file is a file that contains a possible annotation of a microarray chip type. The file typically specifies which probes map to the same genomic unit of interest. This mapping methodology solves the problem of a reliable reconstruction of expression levels as, if more than one probeset per gene exists, expression signals for the same transcript may be enhanced incorrectly. Genomic units of interest may include: Expression, Genotyping, CustomSeq, Copy Number and/or Tag probe sets. All probe set names within an array are unique. Multiple copies of a probe set may exist on a single array as long as each copy has a unique name. CDFsexist for Gene expression (mapping sets of probes to genes), for genotyping (mapping set of probes to Single-nucleotide_polymorphisms and allele type. Different CDFs may exist for a single chip type: one CDF may be used to interrogate gene transcripts and another CDF to interrogate exons. Initially, Affymetrix created the specification to describe the layout for an Affymetrix GeneChip array. Affymetrix still provides "official" CDFs for most of their chip types. In addition to these, various groups provide custom CDF files that are optimized for various genomic features. CDFs are typically updated when the genome annotation is updated. (en)
|
| prov:wasDerivedFrom
| |
| page length (characters) of wiki page
| |
| foaf:isPrimaryTopicOf
| |
| is Link from a Wikipage to another Wikipage
of | |
| is Wikipage redirect
of | |
| is foaf:primaryTopic
of | |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)