About: Minimal genome     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : owl:Thing, within Data Space : dbpedia.org:8891 associated with source document(s)
QRcode icon
http://dbpedia.org:8891/describe/?url=http%3A%2F%2Fdbpedia.org%2Fresource%2FMinimal_genome

The minimal genome is a concept which can be defined as the set of genes sufficient for life to exist and propagate under nutrient-rich and stress-free conditions. Alternatively, it can also be defined as the gene set supporting life on an axenic cell culture in rich media, and it is thought what makes up the minimal genome will depend on the environmental conditions that the organism inhabits. By one early investigation, the minimal genome of a bacterium should include a virtually complete set of proteins for replication and translation, a transcription apparatus including four subunits of RNA polymerase including the sigma factor rudimentary proteins sufficient for recombination and repair, several chaperone proteins, the capacity for anaerobic metabolism through glycolysis and substrate

AttributesValues
rdfs:label
  • Minimalgenom (de)
  • Minimal genome (en)
  • Мінімальний геном (uk)
rdfs:comment
  • Ein Minimalgenom ist ein Genom eines Organismus, das nur die genetische Information enthält, die für das Leben unter definierten Bedingungen notwendig sind. Für werden diese in der Regel durch Gene zur Herstellung der anvisierten Produkte ergänzt. Minimalgenome stellen die Basis für die synthetische Herstellung von Organismen in der synthetischen Biologie dar, mit denen die Effizienz und das Spektrum biotechnologisch genutzter Organismen erhöht werden soll. (de)
  • The minimal genome is a concept which can be defined as the set of genes sufficient for life to exist and propagate under nutrient-rich and stress-free conditions. Alternatively, it can also be defined as the gene set supporting life on an axenic cell culture in rich media, and it is thought what makes up the minimal genome will depend on the environmental conditions that the organism inhabits. By one early investigation, the minimal genome of a bacterium should include a virtually complete set of proteins for replication and translation, a transcription apparatus including four subunits of RNA polymerase including the sigma factor rudimentary proteins sufficient for recombination and repair, several chaperone proteins, the capacity for anaerobic metabolism through glycolysis and substrate (en)
  • Мінімальний геном — найменший набір генів, який є необхідним і достатнім для самостійної життєздатності та відтворення певного організму в найбільш сприятливих для нього умовах. Більшість геномів містять значну кількість допоміжних генів, які можуть надавати додаткові еволюційні переваги, проте які не є обов'язковими для виживання окремих особин. Таким чином, постає можливість створення штучного організму із мінімальним набором життєво-необхідних генів в певному стабільному середовищі. Додавання нових генів до мінімального геному дозволить отримати організми з добре контрольованими бажаними властивостями. (uk)
dcterms:subject
Wikipage page ID
Wikipage revision ID
Link from a Wikipage to another Wikipage
sameAs
dbp:wikiPageUsesTemplate
has abstract
  • Ein Minimalgenom ist ein Genom eines Organismus, das nur die genetische Information enthält, die für das Leben unter definierten Bedingungen notwendig sind. Für werden diese in der Regel durch Gene zur Herstellung der anvisierten Produkte ergänzt. Minimalgenome stellen die Basis für die synthetische Herstellung von Organismen in der synthetischen Biologie dar, mit denen die Effizienz und das Spektrum biotechnologisch genutzter Organismen erhöht werden soll. Das wissenschaftlich bekannteste Projekt zur Herstellung eines Minimalgenoms ist das Mycoplasma laboratorium, das nur die essentiellen Gene einer Mycoplasma-Art enthalten soll. (de)
  • The minimal genome is a concept which can be defined as the set of genes sufficient for life to exist and propagate under nutrient-rich and stress-free conditions. Alternatively, it can also be defined as the gene set supporting life on an axenic cell culture in rich media, and it is thought what makes up the minimal genome will depend on the environmental conditions that the organism inhabits. By one early investigation, the minimal genome of a bacterium should include a virtually complete set of proteins for replication and translation, a transcription apparatus including four subunits of RNA polymerase including the sigma factor rudimentary proteins sufficient for recombination and repair, several chaperone proteins, the capacity for anaerobic metabolism through glycolysis and substrate-level phosphorylation, transamination of glutamyl-tRNA to glutaminyl-tRNA, lipid (but no fatty acid) biosynthesis, eight cofactor enzymes, protein export machinery, and a limited metabolite transport network including membrane ATPases. Proteins involved in the minimum bacterial genome tend to be substantially more related to proteins found in archaea and eukaryotes compared to the average gene in the bacterial genome more generally indicating a substantial number of universally (or near universally) conserved proteins. The minimal genomes reconstructed on the basis of existing genes does not preclude simpler systems in more primitive cells, such as an RNA world genome which does not have the need for DNA replication machinery, which is otherwise part of the minimal genome of current cells. This minimal genome concept assumes that genomes can be reduced to a bare minimum, given that they contain many non-essential genes of limited or situational importance to the organism. Therefore, if a collection of all the essential genes were put together, a minimum genome could be created artificially in a stable environment. By adding more genes, the creation of an organism of desired properties is possible. The concept of minimal genome arose from the observations that many genes do not appear to be necessary for survival. In order to create a new organism a scientist must determine the minimal set of genes required for metabolism and replication. This can be achieved by experimental and computational analysis of the biochemical pathways needed to carry out basic metabolism and reproduction. A good model for a minimal genome is Mycoplasma genitalium due to its very small genome size. Most genes that are used by this organism are usually considered essential for survival; based on this concept a minimal set of 256 genes has been proposed. (en)
  • Мінімальний геном — найменший набір генів, який є необхідним і достатнім для самостійної життєздатності та відтворення певного організму в найбільш сприятливих для нього умовах. Більшість геномів містять значну кількість допоміжних генів, які можуть надавати додаткові еволюційні переваги, проте які не є обов'язковими для виживання окремих особин. Таким чином, постає можливість створення штучного організму із мінімальним набором життєво-необхідних генів в певному стабільному середовищі. Додавання нових генів до мінімального геному дозволить отримати організми з добре контрольованими бажаними властивостями. Найменший геном, який здатний до підтримування життя, містить 473 гени. Він належить штаму JCVI-syn3.0 мікоплазми Mycoplasma mycoides — бактерії зі штучним геномом, яка була створена в 2016 році. (uk)
prov:wasDerivedFrom
page length (characters) of wiki page
foaf:isPrimaryTopicOf
is Link from a Wikipage to another Wikipage of
Faceted Search & Find service v1.17_git139 as of Feb 29 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 08.03.3331 as of Sep 2 2024, on Linux (x86_64-generic-linux-glibc212), Single-Server Edition (62 GB total memory, 39 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software