This HTML5 document contains 341 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n39http://cmb.molgen.mpg.de/
dbthttp://dbpedia.org/resource/Template:
wikipedia-enhttp://en.wikipedia.org/wiki/
n29https://web.archive.org/web/20060705082556/http:/align.genome.jp/
dbrhttp://dbpedia.org/resource/
n54http://tcoffee.crg.cat/
n37http://www.tcoffee.org/
dbpedia-shhttp://sh.dbpedia.org/resource/
dbpedia-arhttp://ar.dbpedia.org/resource/
n43http://sourceforge.net/projects/msa-edna/
dbpedia-hehttp://he.dbpedia.org/resource/
n62http://dbpedia.org/resource/HHpred_/
n15http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/
n64http://meme.sdsc.edu/meme/
n63http://www.mergealign.com/
n42http://www.ch.embnet.org/software/
n16http://compbio.soe.ucsc.edu/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n34https://web.archive.org/web/20100107231637/http:/www.techfak.uni-bielefeld.de/bcd/Curric/MulAli/
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
n59http://www.ebi.ac.uk/Tools/clustalw2/
n26http://www.clustal.org/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n35http://faculty.cs.tamu.edu/shsze/psalign/
n18http://dbpedia.org/resource/File:
dbphttp://dbpedia.org/property/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
dbpedia-idhttp://id.dbpedia.org/resource/
n61http://www.expasy.org/tools/
dbpedia-ukhttp://uk.dbpedia.org/resource/
n21https://web.archive.org/web/20120305164700/http:/www.embl.de/~seqanal/courses/commonCourseContent/
dbohttp://dbpedia.org/ontology/
n56https://web.archive.org/web/20090821192233/http:/bioinf.may.ie/school02/
n57http://www.ebi.ac.uk/Tools/muscle/
dbpedia-srhttp://sr.dbpedia.org/resource/
dbpedia-pthttp://pt.dbpedia.org/resource/
n30http://sourceforge.net/projects/poamsa/files/
dbpedia-jahttp://ja.dbpedia.org/resource/
dbchttp://dbpedia.org/resource/Category:
n66http://dialign.gobics.de/
n33https://web.archive.org/web/20130328131920/http:/blocks.fhcrc.org/
yagohttp://dbpedia.org/class/yago/
dbpedia-ruhttp://ru.dbpedia.org/resource/
n58http://www.ebi.ac.uk/Tools/t-coffee/
wikidatahttp://www.wikidata.org/entity/
goldhttp://purl.org/linguistics/gold/
yago-reshttp://yago-knowledge.org/resource/
n41https://global.dbpedia.org/id/
n7http://www.genome.jp/tools/prrn/
n40https://web.archive.org/web/20110904184621/http:/www.avatar.se/molbioinfo2001/
n27https://web.archive.org/web/20060909003117/http:/pbil.univ-lyon1.fr/
n12https://web.archive.org/web/20100822143504/http:/meme.sdsc.edu/meme/
n55http://www.ebi.ac.uk/Tools/mafft/
dbpedia-cahttp://ca.dbpedia.org/resource/
provhttp://www.w3.org/ns/prov#
foafhttp://xmlns.com/foaf/0.1/
n51http://bs.dbpedia.org/resource/
n67http://www.tcoffee.org/Projects/mcoffee/
n28http://www.stevekellylab.com/software/
dbpedia-zhhttp://zh.dbpedia.org/resource/
dbpedia-kohttp://ko.dbpedia.org/resource/
dbpedia-trhttp://tr.dbpedia.org/resource/
dbpedia-fahttp://fa.dbpedia.org/resource/
dbpedia-glhttp://gl.dbpedia.org/resource/
dbpedia-eshttp://es.dbpedia.org/resource/
freebasehttp://rdf.freebase.com/ns/
n60http://www.ebi.ac.uk/Tools/kalign/
owlhttp://www.w3.org/2002/07/owl#

Statements

Subject Item
dbr:Calciseptine
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Protein_secondary_structure
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Rosetta@home
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:List_of_alignment_visualization_software
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:List_of_disorder_prediction_software
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:List_of_file_formats
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:MAVID
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:MIF4GD
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:MacVector
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:ProbCons
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:David_Sankoff
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Desmond_G._Higgins
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Align-m
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Alignment-free_sequence_analysis
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Paul_M._Sharp
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Pentapeptide_repeat
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Pfam
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Rfam
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Charles_Lawrence_(mathematician)
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:DHRS7B
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:DIALIGN-TX
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:DNA
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:C19orf44
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:CCDC130
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Dynamic_time_warping
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:EMBOSS
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Influenza_Research_Database
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Informative_site
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Sequence_alignment
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Structural_alignment
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:List_of_sequence_alignment_software
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Substitution_model
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:OSER1
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Nucleic_acid_structure_prediction
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Quasi-median_networks
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Protein_contact_map
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Protein_structure_prediction
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Ancestral_sequence_reconstruction
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Maximal_unique_match
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Generalized_tree_alignment
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Genetic_saturation
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Genome_skimming
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:TreeBASE
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:RNA_motif
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Clustal
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Coiled-coil_domain_containing_42B
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Molecular_Evolutionary_Genetics_Analysis
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Molecular_phylogenetics
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Mutual_information
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Conserved_Domain_Database
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Conserved_sequence
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Dan_Gusfield
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:LOC105377021
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:LSm
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Osteochondroma
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:TEX55
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Ankyrin_repeat
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:MAFFT
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:MUSCLE_(alignment_software)
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
dbp:genre
dbr:Multiple_sequence_alignment
dbo:genre
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Stockholm_format
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Computational_phylogenetics
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:PANDIT_(database)
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:PANTHER
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Phylo_(video_game)
rdfs:seeAlso
dbr:Multiple_sequence_alignment
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Machine_learning_in_bioinformatics
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:MicrobesOnline
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Virus_Pathogen_Database_and_Analysis_Resource
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:BAli-Phy
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:CS-BLAST
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:UCSF_Chimera
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:UGENE
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Distance_matrices_in_phylogeny
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Hadamard_transform
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:DEPDC5
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Mir-127
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:PRP36
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:ANOVA–simultaneous_component_analysis
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:DECIPHER_(software)
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:European_Bioinformatics_Institute
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Direct_coupling_analysis
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Fast_statistical_alignment
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Probabilistic_context-free_grammar
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Protein_family
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Regulator_gene
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:HH-suite
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:HMMER
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Jalview
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Bacterial_phylodynamics
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:AMAP
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:LRRC57
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Bioinformatics
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:T-Coffee
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Coiled-coil_domain-containing_protein_135
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Homology_modeling
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Distance_matrix
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Martin_Vingron
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:C10orf35
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:C9orf85
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Phylogenetic_tree
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Source_attribution
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Human-based_computation_game
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Mesquite_(software)
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:RasMol
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:MSA
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
dbo:wikiPageDisambiguates
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Multiple_sequence_alignment
rdf:type
yago:Assistant109815790 yago:Organism100004475 yago:WikicatMarkovModels dbo:ArchitecturalStructure yago:Person100007846 yago:LivingThing100004258 yago:Object100002684 yago:YagoLegalActor yago:YagoLegalActorGeo yago:CausalAgent100007347 yago:Worker109632518 yago:PhysicalEntity100001930 yago:Model110324560 yago:Whole100003553
rdfs:label
Persejajaran sekuen jamak Multiple sequence alignment Множинне вирівнювання послідовностей Alineamiento múltiple de secuencias 多重整列 Alinhamento múltiplo de sequências تراصف السلسلة المتعدد Alineament múltiple de seqüències Множественное выравнивание последовательностей 多重序列比對 다중서열정렬
rdfs:comment
Um alinhamento múltiplo de sequências é um alinhamento de três ou mais sequências biológicas, geralmente proteínas, ADN ou ARN. De modo geral, assume-se que o conjunto de sequências de consulta que se coloca como entrada (conjunto problema) tem uma relação evolutiva pela qual compartilham uma linhagem e descendem de um ancestral comum. Do alinhamento resultante, pode-se inferir a homologia, e pode levar-se a cabo a análise filogenética para avaliar as origens evolutivas compartilhadas pelas sequências. As representações visuais do alinhamento ilustram mutações tais como mutações puntuais (uma só mudança de aminoácidos ou nucleótidos) que aparecem como diferentes caracteres numa só coluna do alinhamento, e a inserção ou supressão de mutações que aparecem como ocos numa ou várias das sequênc 多重整列(たじゅうせいれつ、英: multiple sequence alignment)とは、DNAの塩基配列やタンパク質のアミノ酸配列について、3つ以上の配列間で対応する部分が並ぶように整列したもの、また整列すること。通常、整列する配列群は進化的類縁性を持っていることが仮定される。多重整列の結果に基づいて分子系統樹を推定することができる。 多重序列比對(Multiple sequence alignment;MSA)是對三個以上的(biological sequence),如蛋白質序列、DNA序列或RNA序列所作的序列比對。一般來說,是輸入一組假定擁有演化關係的序列。從MSA的結果可推導出序列的同源性,而關係也可引導出這些序列共同的演化始祖。如右圖般的視覺化敘述可描繪出各種突變事件,例如點突變的單格變化,或是如刪除突變與插入突變,可使各個序列之間產生鴻溝。MSA常用來研究序列的保守性,或是蛋白質結構域的三級結構與二級結構,甚至是個別的氨基酸或核苷酸。 Un alineamiento múltiple de secuencias (MSA, por sus siglas en inglés) es un alineamiento de tres o más secuencias biológicas, generalmente proteínas, ADN o ARN. En general, se asume que el conjunto de secuencias de consulta que se ingresa como entrada (conjunto problema) tienen una relación evolutiva por la cual comparten un linaje y descienden de un ancestro común. Del MSA resultante, se puede inferir la homología, y puede llevarse a cabo el análisis filogenético para evaluar los orígenes evolutivos compartidos por las secuencias. Las representaciones visuales del alineamiento ilustran mutaciones tales como mutaciones puntuales (un solo cambio de aminoácidos o nucleótidos) que aparecen como diferentes caracteres en una sola columna del alineamiento, y las inserciones o supresiones de fra Persejajaran sekuen jamak (bahasa Inggris: multiple sequence alignment) merupakan persejajaran tiga atau lebih sekuen asam nukleat, protein, atau RNA. Persejajaran ini dapat digunakan untuk melihat baik secara keseluruhan ataupun parsial, yang nanti datanya dapat digunakan untuk melihat kekerabatan antar spesies. 다중서열정렬(multiple sequence alignment, MSA)은 다양한 생명체에서 같은 기능을 하는 단백질 서열이나 핵산서열들이 여러 개 있을 때 그들을 한꺼번에 묶어서 서로 정렬하는 방법이다. 대표적인 다중서열정렬 알고리즘으로 clustalW가 있다. تراصف السلسلة المتعدد اختصار MSG (بالإنجليزية: muscle Multiple Sequence Alignment)‏ هو إحدى تطبيقات ال bioinformatics يستخدم لمقارنة عدة سلاسل جينية مع بعضها البعض. هذا الموقع يمكنه مقارنة أكتر من 500 سلسلة ولا يتعدى حجم الملف أكثر من 1MBمن الأفضل مقارنة من 10-15 سلسلة من البروتين ليعطيك نتائج أفضل لكن لا بأس من مقارن أكثر 50 سلسلة Мно́жественное выра́внивание после́довательностей (англ. multiple sequence alignment, MSA) — выравнивание трёх и более биологических последовательностей, обычно белков, ДНК или РНК. В большинстве случаев предполагается, что входной набор последовательностей имеет эволюционную связь. Используя множественное выравнивание, можно оценить эволюционное происхождение последовательностей, проведя филогенетический анализ. Multiple sequence alignment (MSA) may refer to the process or the result of sequence alignment of three or more biological sequences, generally protein, DNA, or RNA. In many cases, the input set of query sequences are assumed to have an evolutionary relationship by which they share a linkage and are descended from a common ancestor. From the resulting MSA, sequence homology can be inferred and phylogenetic analysis can be conducted to assess the sequences' shared evolutionary origins. Visual depictions of the alignment as in the image at right illustrate mutation events such as point mutations (single amino acid or nucleotide changes) that appear as differing characters in a single alignment column, and insertion or deletion mutations (indels or gaps) that appear as hyphens in one or more Множинне вирівнювання послідовностей (англ. multiple sequence alignment, MSA) — вирівнювання трьох і більше біологічних послідовностей, зазвичай білків, ДНК або РНК. У більшості випадків передбачається, що вхідний набір послідовностей має еволюційний зв'язок. Використовуючи множинне вирівнювання можна оцінити еволюційне походження послідовностей, провівши філогенетичний аналіз. Множинне вирівнювання послідовностей часто використовується для оцінки консервативності доменів білків, третинних і вторинних структур і навіть окремих амінокислотних залишків або нуклеотидів. L'alineament múltiple de seqüències (MSA, per les sigles en anglès) es refereix al procés o resultat d’un alineament de seqüències de tres o més seqüències biològiques, generalment proteïnes, ADN o ARN. En alguns casos, es poden trobar relacions evolutives i inclús l'avantpassat comú. En cas que es vulgui inferir homologia s’ha de recórrer a l'anàlisi filogenètic.
foaf:depiction
n15:Caspase-motif-alignment.png n15:Non-homologous_exon_alignment.jpg n15:A_profile_HMM_modelling_a_multiple_sequence_alignment.png n15:RPLP0_90_ClustalW_aln.gif
dcterms:subject
dbc:Bioinformatics dbc:Computational_phylogenetics dbc:Markov_models
dbo:wikiPageID
4066308
dbo:wikiPageRevisionID
1117499053
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:RNA_splicing dbr:Homology_(biology) dbr:Benders_decomposition dbr:Hill-climbing_algorithm dbr:Cladistics dbr:Tertiary_structure dbr:Sequence_alignment_software dbr:UPGMA n18:A_profile_HMM_modelling_a_multiple_sequence_alignment.png dbr:Polynomial_time dbc:Bioinformatics dbr:Directed_acyclic_graph dbr:Expectation-maximization_algorithm dbr:Generalized_tree_alignment dbr:European_Molecular_Biology_Laboratory dbr:Global_optimization dbr:T-Coffee dbr:Multiple_EM_for_Motif_Elicitation dbr:MAFFT dbr:NP_complete dbr:Protein_structure_prediction dbr:List_of_sequence_alignment_software dbr:Quantum_computing dbr:FASTA dbr:Gap_penalty dbr:Dynamic_programming dbr:UGENE dbr:Algorithm dbr:Hidden_Markov_model dbr:DNA dbr:Secondary_structure dbr:Biological_sequence dbr:Evolutionary dbc:Markov_models dbr:Graph_(discrete_mathematics) n18:RPLP0_90_ClustalW_aln.gif dbc:Computational_phylogenetics dbr:Jalview dbr:PANDIT_(database) dbr:Mathematical_programming dbr:Exons dbr:Viterbi_algorithm dbr:Protein_domain dbr:Computational_complexity_theory dbr:Indel dbr:Substitution_matrix dbr:Frameshift dbr:Simulated_annealing dbr:Molecular_phylogeny dbr:Neighbor-joining dbr:Big_O_notation dbr:Yeast dbr:D-Wave_Systems dbr:CASP dbr:MUSCLE_(alignment_software) dbr:Branch_and_price dbr:Mixed_integer_programming dbr:HMMER dbr:Gibbs_sampler dbr:Clustal dbr:Phylogenetic_tree dbr:Amino_acid dbr:Phylogenetics dbr:Phylogeny dbr:Nucleotide dbr:Heuristic dbr:Genetic_algorithm n62:_HHsearch dbr:Cluster_analysis dbr:Phylo dbr:Sequence_motif dbr:Sequence_alignment dbr:S._cerevisiae dbr:Mutation dbr:Pseudocount dbr:Alignment-free_sequence_analysis dbr:Protein dbr:List_of_alignment_visualization_software dbr:RNA dbr:Structural_alignment n18:Caspase-motif-alignment.png dbr:Conservation_(genetics) dbr:Naïve_algorithm dbr:Objective_function n18:Non-homologous_exon_alignment.jpg
dbo:wikiPageExternalLink
n7: n12:intro.html n16:sam.html n21:commonMsaExercises.html n26: n27:alignment.html n28:mergealign n29: n30: n33: n34:welcome.html n35: n37: n39: n40:index.html n42:ClustalW.html n43: n54:tcs n55: n56:notes.html n57: n58: n59: n59:index.html n60: n61:%23align n63: n64:intro.html n66:chaos-dialign-submission n67:
owl:sameAs
dbpedia-pt:Alinhamento_múltiplo_de_sequências dbpedia-ru:Множественное_выравнивание_последовательностей dbpedia-sr:Poravnavanje_višestrukih_sekvenci dbpedia-he:Multiple_sequence_alignment wikidata:Q1377767 dbpedia-gl:Aliñamento_múltiple_de_secuencias dbpedia-es:Alineamiento_múltiple_de_secuencias freebase:m.0bgbn5 dbpedia-ja:多重整列 dbpedia-uk:Множинне_вирівнювання_послідовностей n41:PLtR dbpedia-ko:다중서열정렬 dbpedia-zh:多重序列比對 dbpedia-sh:Poravnavanje_višestrukih_sekvenci yago-res:Multiple_sequence_alignment dbpedia-id:Persejajaran_sekuen_jamak dbpedia-tr:Çoklu_dizi_hizalaması n51:Poravnavanje_višestrukih_sekvenci dbpedia-fa:هم‌ترازسازی_چند_توالی dbpedia-ar:تراصف_السلسلة_المتعدد dbpedia-ca:Alineament_múltiple_de_seqüències
dbp:wikiPageUsesTemplate
dbt:Reflist dbt:Short_description dbt:Cite_book dbt:Webarchive dbt:Cite_journal dbt:Good_article
dbo:thumbnail
n15:RPLP0_90_ClustalW_aln.gif?width=300
dbp:date
2010-08-22
dbp:url
n12:intro.html
dbo:abstract
多重整列(たじゅうせいれつ、英: multiple sequence alignment)とは、DNAの塩基配列やタンパク質のアミノ酸配列について、3つ以上の配列間で対応する部分が並ぶように整列したもの、また整列すること。通常、整列する配列群は進化的類縁性を持っていることが仮定される。多重整列の結果に基づいて分子系統樹を推定することができる。 L'alineament múltiple de seqüències (MSA, per les sigles en anglès) es refereix al procés o resultat d’un alineament de seqüències de tres o més seqüències biològiques, generalment proteïnes, ADN o ARN. En alguns casos, es poden trobar relacions evolutives i inclús l'avantpassat comú. En cas que es vulgui inferir homologia s’ha de recórrer a l'anàlisi filogenètic. Podríem considerar que un MSA és una organització matricial d’un grup de seqüències, en la qual cada fila correspon a una seqüència diferent (per exemple, d’espècies diferents) i cada columna correspon a una posició equivalent en les seqüències. Les representacions visuals de l’alineament mostren les mutacions puntuals (un únic canvi d’aminoàcid o de nucleòtid) que apareixen com diferents caràcters en una mateixa columna, així com les insercions o delecions de fragments, conegudes com a , que apareixen com buits a les seqüències. Per dur a terme aquest procés s’usen algorismes computacionals per produir i analitzar els alineaments. La major part dels programes utilitzen mètodes heurístics en canvi d'optimitzacions globals, ja que trobar un alineament global per moltes seqüències és costós a nivell computacional. Per altra banda, les solucions heurístiques no et donen garanties sobre la qualitat de les mateixes i solen estar per sota de la solució òptima. تراصف السلسلة المتعدد اختصار MSG (بالإنجليزية: muscle Multiple Sequence Alignment)‏ هو إحدى تطبيقات ال bioinformatics يستخدم لمقارنة عدة سلاسل جينية مع بعضها البعض. هذا الموقع يمكنه مقارنة أكتر من 500 سلسلة ولا يتعدى حجم الملف أكثر من 1MBمن الأفضل مقارنة من 10-15 سلسلة من البروتين ليعطيك نتائج أفضل لكن لا بأس من مقارن أكثر 50 سلسلة Множинне вирівнювання послідовностей (англ. multiple sequence alignment, MSA) — вирівнювання трьох і більше біологічних послідовностей, зазвичай білків, ДНК або РНК. У більшості випадків передбачається, що вхідний набір послідовностей має еволюційний зв'язок. Використовуючи множинне вирівнювання можна оцінити еволюційне походження послідовностей, провівши філогенетичний аналіз. Візуалізація вирівнювання ілюструє мутаційні події як точкові мутації (зміна однієї амінокислоти або одного нуклеотиду) у вигляді спеціальних символів в одній колонці вирівнювання, а також гепи — їх вставки або делеції (зображуються знаком дефіса). Множинне вирівнювання послідовностей часто використовується для оцінки консервативності доменів білків, третинних і вторинних структур і навіть окремих амінокислотних залишків або нуклеотидів. Зважаючи на більшу обчислювальну складність в порівнянні з парним вирівнюванням, множинне вирівнювання вимагає більш складні алгоритми. Багато програм використовують евристичні алгоритми, оскільки пошук глобального оптимального вирівнювання для багатьох послідовностей може займати тривалий час. Multiple sequence alignment (MSA) may refer to the process or the result of sequence alignment of three or more biological sequences, generally protein, DNA, or RNA. In many cases, the input set of query sequences are assumed to have an evolutionary relationship by which they share a linkage and are descended from a common ancestor. From the resulting MSA, sequence homology can be inferred and phylogenetic analysis can be conducted to assess the sequences' shared evolutionary origins. Visual depictions of the alignment as in the image at right illustrate mutation events such as point mutations (single amino acid or nucleotide changes) that appear as differing characters in a single alignment column, and insertion or deletion mutations (indels or gaps) that appear as hyphens in one or more of the sequences in the alignment. Multiple sequence alignment is often used to assess sequence conservation of protein domains, tertiary and secondary structures, and even individual amino acids or nucleotides. Computational algorithms are used to produce and analyse the MSAs due to the difficulty and intractability of manually processing the sequences given their biologically-relevant length. MSAs require more sophisticated methodologies than pairwise alignment because they are more computationally complex. Most multiple sequence alignment programs use heuristic methods rather than global optimization because identifying the optimal alignment between more than a few sequences of moderate length is prohibitively computationally expensive. On the other hand, heuristic methods generally fail to give guarantees on the solution quality, with heuristic solutions shown to be often far below the optimal solution on benchmark instances. Um alinhamento múltiplo de sequências é um alinhamento de três ou mais sequências biológicas, geralmente proteínas, ADN ou ARN. De modo geral, assume-se que o conjunto de sequências de consulta que se coloca como entrada (conjunto problema) tem uma relação evolutiva pela qual compartilham uma linhagem e descendem de um ancestral comum. Do alinhamento resultante, pode-se inferir a homologia, e pode levar-se a cabo a análise filogenética para avaliar as origens evolutivas compartilhadas pelas sequências. As representações visuais do alinhamento ilustram mutações tais como mutações puntuais (uma só mudança de aminoácidos ou nucleótidos) que aparecem como diferentes caracteres numa só coluna do alinhamento, e a inserção ou supressão de mutações que aparecem como ocos numa ou várias das sequências no alinhamento. O alinhamento múltiplo de sequências utiliza-se para avaliar a conservação dos domínios proteicos, as estruturas e , e também aminoácidos ou nucleótidos individuais. Os alinhamentos múltiplos de sequências também se referem ao processo de alinhá-las como um conjunto de sequências. Como pode ser difícil alinhar à mão três ou mais sequências de comprimento biologicamente relevante, e quase sempre consome muito tempo, utilizam-se algoritmos computacionais para produzir e analisar os alinhamentos. Os alinhamentos requerem metodologias mais sofisticadas que os alinhamentos de pares porque são computacionalmente mais complexos de produzir. A maior parte dos programas de alinhamento múltiplo de sequências usam métodos heurísticos em lugar de , porque identificar o alinhamento óptimo entre mais de umas poucas sequências de comprimento moderado é proibitivamente custoso computacionalmente. 多重序列比對(Multiple sequence alignment;MSA)是對三個以上的(biological sequence),如蛋白質序列、DNA序列或RNA序列所作的序列比對。一般來說,是輸入一組假定擁有演化關係的序列。從MSA的結果可推導出序列的同源性,而關係也可引導出這些序列共同的演化始祖。如右圖般的視覺化敘述可描繪出各種突變事件,例如點突變的單格變化,或是如刪除突變與插入突變,可使各個序列之間產生鴻溝。MSA常用來研究序列的保守性,或是蛋白質結構域的三級結構與二級結構,甚至是個別的氨基酸或核苷酸。 Persejajaran sekuen jamak (bahasa Inggris: multiple sequence alignment) merupakan persejajaran tiga atau lebih sekuen asam nukleat, protein, atau RNA. Persejajaran ini dapat digunakan untuk melihat baik secara keseluruhan ataupun parsial, yang nanti datanya dapat digunakan untuk melihat kekerabatan antar spesies. Мно́жественное выра́внивание после́довательностей (англ. multiple sequence alignment, MSA) — выравнивание трёх и более биологических последовательностей, обычно белков, ДНК или РНК. В большинстве случаев предполагается, что входной набор последовательностей имеет эволюционную связь. Используя множественное выравнивание, можно оценить эволюционное происхождение последовательностей, проведя филогенетический анализ. Визуальное представление выравнивания иллюстрирует мутационные события как точечные мутации (изменение одной аминокислоты или одного нуклеотида) в виде различающихся символов в одной колонке выравнивания, а также их и делеции (изображаются знаком дефиса, гэпы). Множественное выравнивание последовательностей часто используется для оценки консервативности доменов белков, третичных и вторичных структур и даже отдельных аминокислотных остатков или нуклеотидов. Ввиду большей вычислительной сложности по сравнению с парным выравниванием множественное выравнивание требует более сложные алгоритмы. Многие соответствующие программы используют эвристические алгоритмы, поскольку поиск глобального оптимального выравнивания для многих последовательностей может занимать очень большое время. Un alineamiento múltiple de secuencias (MSA, por sus siglas en inglés) es un alineamiento de tres o más secuencias biológicas, generalmente proteínas, ADN o ARN. En general, se asume que el conjunto de secuencias de consulta que se ingresa como entrada (conjunto problema) tienen una relación evolutiva por la cual comparten un linaje y descienden de un ancestro común. Del MSA resultante, se puede inferir la homología, y puede llevarse a cabo el análisis filogenético para evaluar los orígenes evolutivos compartidos por las secuencias. Las representaciones visuales del alineamiento ilustran mutaciones tales como mutaciones puntuales (un solo cambio de aminoácidos o nucleótidos) que aparecen como diferentes caracteres en una sola columna del alineamiento, y las inserciones o supresiones de fragmentos (o indels), que aparecen como huecos en una o varias de las secuencias en la alineación. El alineamiento múltiple de secuencias a menudo se utiliza para evaluar la conservación de los dominios proteicos, las estructuras terciarias y secundarias, e incluso aminoácidos o nucleótidos individuales. Los alineamientos múltiples de secuencias también se refieren al proceso de alinearlas como un conjunto de secuencias. Como puede ser difícil alinear a mano tres o más secuencias de longitud biológicamente relevante, y casi siempre consume mucho tiempo, se utilizan algoritmos computacionales para producir y analizar los alineamientos. Los MSA requieren metodologías más sofisticadas que los alineamiento de pares porque son computacionalmente más complejos de producir. La mayor parte de los programas de alineamiento múltiple de secuencias usan métodos heurísticos en lugar de optimización global, porque identificar el alineamiento óptimo entre más de unas pocas secuencias de longitud moderada es prohibitivamente costoso computacionalmente. 다중서열정렬(multiple sequence alignment, MSA)은 다양한 생명체에서 같은 기능을 하는 단백질 서열이나 핵산서열들이 여러 개 있을 때 그들을 한꺼번에 묶어서 서로 정렬하는 방법이다. 대표적인 다중서열정렬 알고리즘으로 clustalW가 있다.
gold:hypernym
dbr:Alignment
prov:wasDerivedFrom
wikipedia-en:Multiple_sequence_alignment?oldid=1117499053&ns=0
dbo:wikiPageLength
52557
foaf:isPrimaryTopicOf
wikipedia-en:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Statistical_coupling_analysis
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Simple_Modular_Architecture_Research_Tool
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Sequence_logo
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Multiple_Sequence_Alignment
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
dbo:wikiPageRedirects
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Evolutionary_taxonomy
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:TIGRFAMs
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Tree_alignment
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Mycobacterium
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:PRINTS
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:T-REX_(web_server)
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:TMEM81
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Protein_engineering
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Multiple_Epidermal_Growth_Factor-like_Domains_8
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Phylogenetic_inference_using_transcriptomic_data
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Phylogenetic_invariants
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:PhylomeDB
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Αr15_RNA
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Sequence_graph
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:LRRN3
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Outline_of_machine_learning
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:PBDC1
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Paraphrasing_(computational_linguistics)
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Xrate
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:List_of_protein_tandem_repeat_annotation_software
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
dbr:Multiple_alignment
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Multiple_sequence_alignment
dbo:wikiPageRedirects
dbr:Multiple_sequence_alignment
Subject Item
wikipedia-en:Multiple_sequence_alignment
foaf:primaryTopic
dbr:Multiple_sequence_alignment