HTML Microdata document

This HTML5 document contains 99 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

Prefix	IRI
dbt	http://dbpedia.org/resource/Template:
wikipedia-en	http://en.wikipedia.org/wiki/
dbr	http://dbpedia.org/resource/
dbpedia-ar	http://ar.dbpedia.org/resource/
n35	http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/
n42	https://www.bx.psu.edu/~rsharris/lastz/
dcterms	http://purl.org/dc/terms/
rdfs	http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
dbpedia-cs	http://cs.dbpedia.org/resource/
n27	https://web.archive.org/web/20161003142547/http:/www.ac-nice.fr/svt/productions/html5/dotplot/
rdf	http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n46	https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/
n8	http://sourceforge.net/projects/
n39	http://dbpedia.org/resource/File:
dbp	http://dbpedia.org/property/
n25	http://www.ac-nice.fr/svt/productions/html5/dotplot/
n34	http://cube.univie.ac.at/
n18	https://4virology.net/virology-ca-tools/jdotter/
xsdh	http://www.w3.org/2001/XMLSchema#
dbo	http://dbpedia.org/ontology/
n5	https://genomevolution.org/coge/
n40	http://last.cbrc.jp/
n31	https://github.com/molbio-dresden/
dbpedia-ja	http://ja.dbpedia.org/resource/
n19	https://web.archive.org/web/20160416103836/https:/ugene.unipro.ru/wiki/display/UUOUM15/
dbc	http://dbpedia.org/resource/Category:
dbpedia-de	http://de.dbpedia.org/resource/
n36	http://dgenies.toulouse.inra.fr/
yago	http://dbpedia.org/class/yago/
n4	http://www.csb.yale.edu/userguides/graphics/whatif/html/
wikidata	http://www.wikidata.org/entity/
n24	http://globin.bx.psu.edu/dist/laj/
gold	http://purl.org/linguistics/gold/
n41	https://global.dbpedia.org/id/
yago-res	http://yago-knowledge.org/resource/
n30	https://github.com/evolvedmicrobe/
n32	http://bioinfo.cristal.univ-lille.fr/yass/
n20	http://sonnhammer.sbc.su.se/
prov	http://www.w3.org/ns/prov#
foaf	http://xmlns.com/foaf/0.1/
n45	http://www.bioinformatics.nl/cgi-bin/emboss/
n12	https://cran.r-project.org/web/packages/seqinr/
dbpedia-fa	http://fa.dbpedia.org/resource/
n23	http://www.code10.info/
freebase	http://rdf.freebase.com/ns/
n44	http://myhits.isb-sib.ch/cgi-bin/
owl	http://www.w3.org/2002/07/owl#

Statements

Subject Item: dbr:METTL26
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Dot_plot_(bioinformatics)

Subject Item: dbr:MacVector
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Dot_plot_(bioinformatics)

Subject Item: dbr:Pentapeptide_repeat
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Dot_plot_(bioinformatics)

Subject Item: dbr:Dot_plot_(bioinformatics)
rdf:type: yago:VisualCommunication106873252 yago:Communication100033020 dbo:Software yago:Abstraction100002137 yago:Chart106999802 yago:WikicatStatisticalChartsAndDiagrams
rdfs:label: Dot plot ドットプロット (バイオインフォマティクス) Dot plot (bioinformatics) Dotplot مخطط نقطي
rdfs:comment: Ein Dotplot (englisch für „Punktauftragung“) ist eine graphische Methode der Bioinformatik zwei biologische Sequenzen miteinander (oder eine Sequenz mit sich selbst) zu vergleichen. Dabei werden die Sequenzen auf die horizontale und vertikale Achse (oben und links) aufgetragen und Übereinstimmungen zwischen einer Zeile und Spalte an der entsprechenden Schnittstelle durch einen Punkt (englisch „dot“) markiert. In bioinformatics a dot plot is a graphical method for comparing two biological sequences and identifying regions of close similarity after sequence alignment. It is a type of recurrence plot. Dot plot je nejjednodušší bioinformatickou metodou pro srovnávání 2 sekvencí, tzv. pairwise sequence alignment. في المعلوماتية الحيوية نقطة مؤامرة هي طريقة رسومية تسمح بمقارنة اثنين من التسلسل البيولوجي وتحديد مناطق تشابه وثيقة بينهما. بل هو نوع من أشكال التكرار. バイオインフォマティクスにおけるドットプロット（Dot plot）とは、蛋白質のアミノ酸配列または核酸の塩基配列を互いに比較し相同性を明らかにするためのグラフである。考案者Robert Harrにちなみハー・プロット（Harr plot）とも呼ばれる。縦軸（上から下へ）および横軸（左から右へ）に各配列をとり、一致した点にプロットする。すると同じ配列がある部分には線が現れるため、相同性を直感的に確認することができる。例のように両軸に全く同じ配列（例えば同じ遺伝子）をとれば、右下がりの対角線が現れ、全体としてはこれを中心として対称な図形となり、そのほかにも部分的な相同性があれば右下がりの短い線が現れる。また、ゲノムまたはその一部の塩基配列を対象とした場合、対角線以外に長い線が現れれば、これは遺伝子重複を表す。また右下がりだけでなく右上がりの線が現れることもあり、これは相同性のある配列の方向が逆転していること（逆位）を表す。これは比較ゲノミクスに有用な方法である。
foaf:depiction: n35:Zinc-finger-dot-plot.png
dcterms:subject: dbc:Bioinformatics dbc:Statistical_charts_and_diagrams
dbo:wikiPageID: 8634376
dbo:wikiPageRevisionID: 1118662402
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Comparative_genomics dbc:Bioinformatics dbr:Low-complexity_regions dbr:Protein_contact_map dbr:Sequence_alignment dbr:Direct_relationship n39:Zinc-finger-dot-plot.png dbr:Sequence_(biology) dbr:Bioinformatics dbr:Self-similarity_matrix dbr:Recurrence_plot dbc:Statistical_charts_and_diagrams dbr:Tuple
dbo:wikiPageExternalLink: n4:chap13.html n5:SynMap.pl n8:genomdiff n12:index.html n18: n19:Dotplot n20:Dotter.html n23:index.php%3Foption=com_content&view=category&id=52&Itemid=76 n23:index.php%3Fview=article&catid=50%3Acat_coding_software_serolis&id=63%3Aserolis-software-package-for-dot-plot-creation&option=com_content&Itemid=61 n24: n25:index.htm%3Farn=true n30:dotplot n31:flexidot n32:index.php n34:gepard n27:index.htm%3Farn=true n36: n40: n42: n44:dotlet n45:dotmatcher n46:Blast.cgi
owl:sameAs: wikidata:Q669251 yago-res:Dot_plot_(bioinformatics) dbpedia-ar:مخطط_نقطي dbpedia-cs:Dot_plot dbpedia-ja:ドットプロット_(バイオインフォマティクス) dbpedia-de:Dotplot dbpedia-fa:رسم_نقطه‌ای freebase:m.027bw_2 n41:4rBN2
dbp:wikiPageUsesTemplate: dbt:About dbt:Webarchive
dbo:thumbnail: n35:Zinc-finger-dot-plot.png?width=300
dbp:date: 2016-10-03
dbp:url: n27:index.htm%3Farn=true
dbo:abstract: バイオインフォマティクスにおけるドットプロット（Dot plot）とは、蛋白質のアミノ酸配列または核酸の塩基配列を互いに比較し相同性を明らかにするためのグラフである。考案者Robert Harrにちなみハー・プロット（Harr plot）とも呼ばれる。縦軸（上から下へ）および横軸（左から右へ）に各配列をとり、一致した点にプロットする。すると同じ配列がある部分には線が現れるため、相同性を直感的に確認することができる。例のように両軸に全く同じ配列（例えば同じ遺伝子）をとれば、右下がりの対角線が現れ、全体としてはこれを中心として対称な図形となり、そのほかにも部分的な相同性があれば右下がりの短い線が現れる。また、ゲノムまたはその一部の塩基配列を対象とした場合、対角線以外に長い線が現れれば、これは遺伝子重複を表す。また右下がりだけでなく右上がりの線が現れることもあり、これは相同性のある配列の方向が逆転していること（逆位）を表す。これは比較ゲノミクスに有用な方法である。 Ein Dotplot (englisch für „Punktauftragung“) ist eine graphische Methode der Bioinformatik zwei biologische Sequenzen miteinander (oder eine Sequenz mit sich selbst) zu vergleichen. Dabei werden die Sequenzen auf die horizontale und vertikale Achse (oben und links) aufgetragen und Übereinstimmungen zwischen einer Zeile und Spalte an der entsprechenden Schnittstelle durch einen Punkt (englisch „dot“) markiert. Der Dotplot dient der Auffindung von ähnlichen bzw. übereinstimmenden Regionen. Diese Darstellung wurde erstmals 1970 von Gibbs und McIntyre publiziert und wurde seitdem weiterentwickelt. Obwohl fast 50 Jahre alt, finden Dotplots noch immer Eingang in aktuelle Publikationen, wie z. B. bei der Analyse der epigenetischen Steuerung in Pflanzen. In bioinformatics a dot plot is a graphical method for comparing two biological sequences and identifying regions of close similarity after sequence alignment. It is a type of recurrence plot. Dot plot je nejjednodušší bioinformatickou metodou pro srovnávání 2 sekvencí, tzv. pairwise sequence alignment. في المعلوماتية الحيوية نقطة مؤامرة هي طريقة رسومية تسمح بمقارنة اثنين من التسلسل البيولوجي وتحديد مناطق تشابه وثيقة بينهما. بل هو نوع من أشكال التكرار.
gold:hypernym: dbr:Method
prov:wasDerivedFrom: wikipedia-en:Dot_plot_(bioinformatics)?oldid=1118662402&ns=0
dbo:wikiPageLength: 9650
foaf:isPrimaryTopicOf: wikipedia-en:Dot_plot_(bioinformatics)

Subject Item: dbr:Sequence_alignment
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Dot_plot_(bioinformatics)

Subject Item: dbr:Protein_contact_map
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Dot_plot_(bioinformatics)

Subject Item: dbr:Plot_(graphics)
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Dot_plot_(bioinformatics)

Subject Item: dbr:UGENE
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Dot_plot_(bioinformatics)

Subject Item: dbr:Dot_matrix_(disambiguation)
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Dot_plot_(bioinformatics)

Subject Item: dbr:Dot_plot
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Dot_plot_(bioinformatics)
dbo:wikiPageDisambiguates: dbr:Dot_plot_(bioinformatics)

Subject Item: dbr:Recurrence_plot
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Dot_plot_(bioinformatics)

Subject Item: dbr:Circular_permutation_in_proteins
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Dot_plot_(bioinformatics)

Subject Item: dbr:Yass_(software)
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Dot_plot_(bioinformatics)

Subject Item: dbr:Sequence_(biology)
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Dot_plot_(bioinformatics)

Subject Item: dbr:Sequence_analysis
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Dot_plot_(bioinformatics)

Subject Item: dbr:List_of_statistics_articles
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Dot_plot_(bioinformatics)

Subject Item: dbr:Self-similarity_matrix
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Dot_plot_(bioinformatics)

Subject Item: dbr:Viral_Bioinformatics_Resource_Center
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Dot_plot_(bioinformatics)

Subject Item: dbr:List_of_protein_tandem_repeat_annotation_software
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Dot_plot_(bioinformatics)

Subject Item: wikipedia-en:Dot_plot_(bioinformatics)
foaf:primaryTopic: dbr:Dot_plot_(bioinformatics)