About: Varidnaviria

An Entity of Type: disease, from Named Graph: http://dbpedia.org, within Data Space: dbpedia.org

Varidnaviria is a realm of viruses that includes all DNA viruses that encode major capsid proteins that contain a vertical jelly roll fold. The major capsid proteins (MCP) form into pseudohexameric subunits of the viral capsid, which stores the viral deoxyribonucleic acid (DNA), and are perpendicular, or vertical, to the surface of the capsid. Apart from this, viruses in the realm also share many other characteristics, such as minor capsid proteins (mCP) with the vertical jelly roll fold, an ATPase that packages viral DNA into the capsid, and a DNA polymerase that replicates the viral genome.

Property Value
dbo:abstract
  • Varidnaviria ist ein Realm von Viren.Die Viren aus diesem Realm sind gekennzeichnet durch vertikal gefaltete Jelly-Roll-Kapside mit pseudohexameren (aus drei verschiedenen Dimeren oder zwei verschiedenen Trimeren bestehenden) Kapsomeren.In dem Realm sind auch Vertreter, die keine solchen Strukturen aufweisen, deren evolutionäre Verwandtschaft mit Mitgliedern des Reiches aber klar nachgewiesen werden kann – höchstwahrscheinlich haben sie diese im Lauf der Evolution verloren. Der erste Teil des Namens (vari) kommt aus dem Englischen (various); der mittlere Teil (dna) bezieht sich auf die Desoxyribonukleinsäure (DNA), da alle Mitglieder des Realm doppelsträngige DNA-Viren (dsDNA) sind; und der letzte Teil (viria) ist das Suffix für Realm. Ein früherer Namensvorschlag für diesen Realm hatte ähnlich auf Divdnaviria gelautet (mit div für diverse). Die Varidnaviria gehören als doppelsträngige DNA-Viren in der Baltimore-Klassifikation zur Gruppe I. (de)
  • Varidnaviria es un dominio de virus de ADN establecido por el ICTV que incluye los virus que se caracterizan por tener una proteína en vertical dentro la cápside, que puede ser en doble rollo (DJR-MCP) o en simple rollo (SJR-MCP). En este dominio se incluye a los virus gigantes, los virófagos, los adenovirus y varias familias de virus procariotas. El dominio contiene dos reinos y tres filos.​ La proteína específica de este dominio es similar a una proteína celular llamada nucleoplasmina.​ Los genomas de casi todos sus miembros son de ADN bicatenario, aunque una de sus familias propuesta Finnlakeviridae tiene un genoma de ADN monocatenario pero evolucionaron de virus de ADN bicatenario de este dominio.​ (es)
  • Varidnaviria adalah dunia virus yangmencakup semua virus DNA yang mengkode protein kapsid utama yang mengandung lipatan jelly roll vertikal. Protein kapsid utama (MCP) terbentuk menjadi subunit pseudohexameric dari kapsid virus, yang menyimpan asam deoksiribonukleat (DNA), dan tegak lurus, atau vertikal, ke permukaan kapsid. Selain itu, virus di alam juga memiliki banyak karakteristik lain, seperti protein kapsid minor (mCP) dengan lipatan jelly roll vertikal, ATPase yang mengemas DNA virus ke dalam kapsid, dan DNA polimerase .yang mereplikasi . Varidnaviria dibuat pada tahun 2019 berdasarkan kesamaan karakteristik virus di dunia. Ada dua kelompok virus di Varidnaviria : virus yang memiliki lipatan ganda vertikal jelly roll (DJR) di MCP, ditugaskan ke kerajaan Bamfordvirae, dan virus yang memiliki satu lipatan vertikal jelly roll (SJR) di MCP, ditugaskan untuk kerajaan Helvetiavirae. Garis keturunan DJR-MCP dianggap diturunkan dari garis keturunan SJR-MCP melalui peristiwa fusi gen , dan SJR-MCP menunjukkan hubungan yang erat dengan nukleoplasmin , menunjuk ke kemungkinan asal usul MCP lipatan gulung jeli alam. Sebagian besar yang teridentifikasi milik Varidnaviria. Virus laut di alam sangat melimpah di seluruh dunia dan penting dalam ekologi laut. Banyak virus hewan di alam terkait dengan penyakit, termasuk , , dan virus demam babi Afrika. Poxvirus telah menonjol dalam sejarah kedokteran, terutama cacar, yang disebabkan oleh virus Variola , yang menjadi target vaksin pertama dan kemudian menjadi penyakit pertama yang diberantas. Ranah juga secara khusus mencakup virus raksasa yang secara fisik lebih besar dan mengandung jumlah gen yang jauh lebih besar daripada virus biasa. (in)
  • ウァリドナウィリア(Varidnaviria)またはバリドナウイルス域は、2019年に国際ウイルス分類委員会(ICTV)によって提案されたウイルスの分類群(域、Realm)。垂直のゼリーロール構造を持ち、疑似六量体カプソマーを形成する主要カプシドタンパク質(MCP)を持つ二本鎖のDNAウイルスを含む。また、これらの構造を持たない場合であっても、進化的に強く関連付けられるウイルスがここに含まれる。多くの場合、パッケージタンパク質やDNAポリメラーゼも進化的に共通している。 垂直のゼリーロール構造とは、対向する4対の逆平行βシート(ゼリーロール)が、カプシド殻面に対して垂直に配置していることを意味する。リボウィリア(リボウイルス域)の一部ウイルスも主要カプシドタンパク質にゼリーロール構造を持つが、これらは大半がRNAウイルスであり、またゼリーロールがカプシド殻面に対して平行に配置している。 ボルティモア分類でいう第1群(2本鎖DNAウイルス)の一部がウァリドナウィリアに対応している。残りの2本鎖DNAウイルスの大半は、ドゥプロドナウィリア(デュプロドナウイルス域)に属している。ドゥプロドナウィリアは尾部を持つ物が多いことから、ウァリドナウィリアは無尾の二本鎖DNAウイルスと呼ばれることがある。 (ja)
  • Varidnaviria is a realm of viruses that includes all DNA viruses that encode major capsid proteins that contain a vertical jelly roll fold. The major capsid proteins (MCP) form into pseudohexameric subunits of the viral capsid, which stores the viral deoxyribonucleic acid (DNA), and are perpendicular, or vertical, to the surface of the capsid. Apart from this, viruses in the realm also share many other characteristics, such as minor capsid proteins (mCP) with the vertical jelly roll fold, an ATPase that packages viral DNA into the capsid, and a DNA polymerase that replicates the viral genome. Varidnaviria was established in 2019 based on the shared characteristics of the viruses in the realm. There are two groups of viruses in Varidnaviria: viruses that have a double vertical jelly roll (DJR) folds in the MCP, assigned to the kingdom Bamfordvirae, and viruses that have a single vertical jelly roll (SJR) fold in the MCP, assigned to the kingdom Helvetiavirae. The DJR-MCP lineage is thought to be descended from the SJR-MCP lineage via a gene fusion event, and the SJR-MCP shows a close relation to nucleoplasmins, pointing to a possible origin of the realm's jelly roll fold MCP. Most identified eukaryotic DNA viruses belong to Varidnaviria. Marine viruses in the realm are highly abundant worldwide and are important in marine ecology. Many animal viruses in the realm are associated with disease, including adenoviruses, poxviruses, and the African swine fever virus. Poxviruses have been prominent in the history of medicine, especially smallpox, caused by Variola virus, which was the target of the first vaccine and which later became the first disease eradicated. The realm also notably includes giant viruses that are physically larger and contain a much larger number of genes than typical viruses. (en)
  • Varidnaviria is een imperium van virussen waartoe alle DNA-virussen behoren die coderen voor capside-eiwitten waarin zogenaamde jelly roll-structuur voorkomt (een speciale vouwingsstructuur). De capside-eiwitten (capsomeren) vormen pseudohexamere subunits. Binnen de capside is het virale desoxyribonucleïnezuur (DNA) opgeslagen. Naast de jelly roll kenmerken deze virussen ook door de enzymen ATPase die het viraal DNA in de capside verpakken en een gespecialiseerde DNA-polymerase dat het virale genoom repliceert. Varidnaviria werd in 2019 vastgesteld op basis van geconserveerde eiwitstructuren. Binnen het imperium worden twee hoofdgroepen (rijken) onderscheiden op basis van hun jelly roll-structuur. Virussen met een dubbele jelly roll behoren tot het rijk Bamfordvirae, virussen met een enkele jelly roll tot de Helvetiavirae. Bijna alle DNA-virussen die eukaryoten infecteren maken deel uit van dit imperium. Veel virussoorten in dit imperium komen voor in zee. Ze zijn zeer talrijk en spelen een belangrijk rol in de mariene ecologie. De dierenvirussen in het imperium, zoals de adenovirussen of , zijn de oorzaak van bekende infectieziekten. Pokkenvirussen hebben een grote rol gespeeld in de geschiedenis van de geneeskunde. Pokken was het doelwit van een van de eerste vaccins en zou later als eerste ziekte ziekteverwekker definitief worden uitgeroeid. Het imperium omvat ook reuzenvirussen die fysiek veel groter zijn en veel meer genen bevatten dan gewone virussen. (nl)
  • Varidnaviria (лат.) — реалм ДНК-содержащих вирусов. Общей чертой, объединяющей представителей реалма, является присутствие (укладки), известного как вертикальный jelly roll, в составе мажорного капсидного белка. Молекулы мажорного капсидного белка формируют псевдогексамерные капсомеры. Также вирусы из реалма Varidnaviria обладают такими белками, как минорный капсидный белок с мотивом вертикальный jelly roll, АТФазой, упаковывающей вирусный ДНК-геном в капсид, и собственной ДНК-полимеразой, реплицирующий вирусные геномы. В состав реалма Varidnaviria входит большинство ДНК-содержащих вирусов эукариот, например, , многие вирусы, патогенные для человека (например, аденовирусы и поксвирусы), вирус африканской чумы свиней, а также гигантские вирусы, инфицирующие амёб и обладающие огромными вирионами и геномами по меркам вирусов. (ru)
  • Varidnaviria é um reino de vírus que inclui todos os vírus de DNA que codificam as principais proteínas do capsídeo que contêm uma dobra vertical de gelatina. As proteínas do capsídeo principal (MCP) se formam em subunidades pseudo-hexaméricas do capsídeo viral, que armazena o ácido desoxirribonucleico (DNA) viral e são perpendiculares ou verticais à superfície do capsídeo. Além disso, os vírus no reino também compartilham muitas outras características, como proteínas menores do capsídeo (mCP) com a dobra vertical de gelatina, uma ATPase que empacota DNA viral no capsídeo e uma DNA polimerase que replica o genoma viral. A Varidnaviria foi criada em 2019 com base nas características compartilhadas dos vírus no reino. Existem dois grupos de vírus em Varidnaviria : vírus que têm uma dobra vertical de gelatina dupla (DJR) no MCP, atribuído ao reino Bamfordvirae, e vírus que têm uma única dobra vertical de geleia de rolo (SJR) no MCP, atribuído a o reino Helvetiavirae. Acredita-se que a linhagem DJR-MCP seja descendente da linhagem SJR-MCP através de um evento de fusão gênica, e o SJR-MCP mostra uma estreita relação com as nucleoplasminas, apontando para uma possível origem do MCP do reino. A maioria dos vírus de DNA eucarióticos identificados pertence à Varidnaviria. Os vírus marinhos no reino são altamente abundantes em todo o mundo e são importantes na ecologia marinha. Muitos vírus animais no reino estão associados a doenças, incluindo adenovírus, poxvírus e o vírus da peste suína africana. Os poxvírus têm se destacado na história da medicina, principalmente a varíola, causada pelo vírus Variola, que foi alvo da primeira vacina e que mais tarde se tornou a primeira doença erradicada. O reino também inclui vírus gigantes que são fisicamente maiores e contêm um número muito maior de genes do que os vírus típicos. (pt)
  • 多變去氧核糖核酸病毒域(學名:Varidnaviria)又名多變DNA病毒域,是國際病毒分類委員會2020年版分類中所設立的6個病毒域(Realm)之一,包含了一群具有結構的DNA病毒,如天花病毒、腺病毒均属於本域。 (zh)
  • Varidnaviria — реалм вірусів. Запропонований у 2019 році. (uk)
dbo:thumbnail
dbo:wikiPageID
  • 63771196 (xsd:integer)
dbo:wikiPageLength
  • 29531 (xsd:nonNegativeInteger)
dbo:wikiPageRevisionID
  • 1103770533 (xsd:integer)
dbo:wikiPageWikiLink
dbp:imageCaption
  • A ribbon diagram of the DJR-MCP of Pseudoalteromonas virus PM2, with the two jelly roll folds colored in red and blue (en)
dbp:subdivision
  • [[#Classification (en)
dbp:subdivisionRanks
  • Subtaxa (en)
dbp:synonyms
  • * Non-tailed dsDNA viruses * Tailless dsDNA viruses (en)
dbp:taxon
  • Varidnaviria (en)
dbp:wikiPageUsesTemplate
dcterms:subject
rdf:type
rdfs:comment
  • ウァリドナウィリア(Varidnaviria)またはバリドナウイルス域は、2019年に国際ウイルス分類委員会(ICTV)によって提案されたウイルスの分類群(域、Realm)。垂直のゼリーロール構造を持ち、疑似六量体カプソマーを形成する主要カプシドタンパク質(MCP)を持つ二本鎖のDNAウイルスを含む。また、これらの構造を持たない場合であっても、進化的に強く関連付けられるウイルスがここに含まれる。多くの場合、パッケージタンパク質やDNAポリメラーゼも進化的に共通している。 垂直のゼリーロール構造とは、対向する4対の逆平行βシート(ゼリーロール)が、カプシド殻面に対して垂直に配置していることを意味する。リボウィリア(リボウイルス域)の一部ウイルスも主要カプシドタンパク質にゼリーロール構造を持つが、これらは大半がRNAウイルスであり、またゼリーロールがカプシド殻面に対して平行に配置している。 ボルティモア分類でいう第1群(2本鎖DNAウイルス)の一部がウァリドナウィリアに対応している。残りの2本鎖DNAウイルスの大半は、ドゥプロドナウィリア(デュプロドナウイルス域)に属している。ドゥプロドナウィリアは尾部を持つ物が多いことから、ウァリドナウィリアは無尾の二本鎖DNAウイルスと呼ばれることがある。 (ja)
  • 多變去氧核糖核酸病毒域(學名:Varidnaviria)又名多變DNA病毒域,是國際病毒分類委員會2020年版分類中所設立的6個病毒域(Realm)之一,包含了一群具有結構的DNA病毒,如天花病毒、腺病毒均属於本域。 (zh)
  • Varidnaviria — реалм вірусів. Запропонований у 2019 році. (uk)
  • Varidnaviria ist ein Realm von Viren.Die Viren aus diesem Realm sind gekennzeichnet durch vertikal gefaltete Jelly-Roll-Kapside mit pseudohexameren (aus drei verschiedenen Dimeren oder zwei verschiedenen Trimeren bestehenden) Kapsomeren.In dem Realm sind auch Vertreter, die keine solchen Strukturen aufweisen, deren evolutionäre Verwandtschaft mit Mitgliedern des Reiches aber klar nachgewiesen werden kann – höchstwahrscheinlich haben sie diese im Lauf der Evolution verloren. (de)
  • Varidnaviria es un dominio de virus de ADN establecido por el ICTV que incluye los virus que se caracterizan por tener una proteína en vertical dentro la cápside, que puede ser en doble rollo (DJR-MCP) o en simple rollo (SJR-MCP). En este dominio se incluye a los virus gigantes, los virófagos, los adenovirus y varias familias de virus procariotas. El dominio contiene dos reinos y tres filos.​ La proteína específica de este dominio es similar a una proteína celular llamada nucleoplasmina.​ (es)
  • Varidnaviria adalah dunia virus yangmencakup semua virus DNA yang mengkode protein kapsid utama yang mengandung lipatan jelly roll vertikal. Protein kapsid utama (MCP) terbentuk menjadi subunit pseudohexameric dari kapsid virus, yang menyimpan asam deoksiribonukleat (DNA), dan tegak lurus, atau vertikal, ke permukaan kapsid. Selain itu, virus di alam juga memiliki banyak karakteristik lain, seperti protein kapsid minor (mCP) dengan lipatan jelly roll vertikal, ATPase yang mengemas DNA virus ke dalam kapsid, dan DNA polimerase .yang mereplikasi . (in)
  • Varidnaviria is a realm of viruses that includes all DNA viruses that encode major capsid proteins that contain a vertical jelly roll fold. The major capsid proteins (MCP) form into pseudohexameric subunits of the viral capsid, which stores the viral deoxyribonucleic acid (DNA), and are perpendicular, or vertical, to the surface of the capsid. Apart from this, viruses in the realm also share many other characteristics, such as minor capsid proteins (mCP) with the vertical jelly roll fold, an ATPase that packages viral DNA into the capsid, and a DNA polymerase that replicates the viral genome. (en)
  • Varidnaviria is een imperium van virussen waartoe alle DNA-virussen behoren die coderen voor capside-eiwitten waarin zogenaamde jelly roll-structuur voorkomt (een speciale vouwingsstructuur). De capside-eiwitten (capsomeren) vormen pseudohexamere subunits. Binnen de capside is het virale desoxyribonucleïnezuur (DNA) opgeslagen. Naast de jelly roll kenmerken deze virussen ook door de enzymen ATPase die het viraal DNA in de capside verpakken en een gespecialiseerde DNA-polymerase dat het virale genoom repliceert. (nl)
  • Varidnaviria é um reino de vírus que inclui todos os vírus de DNA que codificam as principais proteínas do capsídeo que contêm uma dobra vertical de gelatina. As proteínas do capsídeo principal (MCP) se formam em subunidades pseudo-hexaméricas do capsídeo viral, que armazena o ácido desoxirribonucleico (DNA) viral e são perpendiculares ou verticais à superfície do capsídeo. Além disso, os vírus no reino também compartilham muitas outras características, como proteínas menores do capsídeo (mCP) com a dobra vertical de gelatina, uma ATPase que empacota DNA viral no capsídeo e uma DNA polimerase que replica o genoma viral. (pt)
  • Varidnaviria (лат.) — реалм ДНК-содержащих вирусов. Общей чертой, объединяющей представителей реалма, является присутствие (укладки), известного как вертикальный jelly roll, в составе мажорного капсидного белка. Молекулы мажорного капсидного белка формируют псевдогексамерные капсомеры. Также вирусы из реалма Varidnaviria обладают такими белками, как минорный капсидный белок с мотивом вертикальный jelly roll, АТФазой, упаковывающей вирусный ДНК-геном в капсид, и собственной ДНК-полимеразой, реплицирующий вирусные геномы. (ru)
rdfs:label
  • Varidnaviria (de)
  • Varidnaviria (es)
  • Varidnaviria (in)
  • ウァリドナウィリア (ja)
  • Varidnaviria (nl)
  • Varidnaviria (ru)
  • Varidnaviria (pt)
  • Varidnaviria (en)
  • 多變去氧核糖核酸病毒域 (zh)
  • Varidnaviria (uk)
owl:sameAs
prov:wasDerivedFrom
foaf:depiction
foaf:isPrimaryTopicOf
is dbo:wikiPageWikiLink of
is foaf:primaryTopic of
Powered by OpenLink Virtuoso    This material is Open Knowledge     W3C Semantic Web Technology     This material is Open Knowledge    Valid XHTML + RDFa
This content was extracted from Wikipedia and is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License