An Entity of Type: video game, from Named Graph: http://dbpedia.org, within Data Space: dbpedia.org

2'-O-methylation is a common nucleoside modification of RNA, where a methyl group is added to the 2' hydroxyl of the ribose moiety of a nucleoside, producing a methoxy group. 2'-O-methylated nucleosides are mostly found in ribosomal RNA and small nuclear RNA and occur in the functionally essential regions of the ribosome and spliceosome. Currently, about 1210 2'-O-methylations (2'-O-Me) have been identified in mammals and yeast and deposited in RMBase (RNA Modification Base) database.

Property Value
dbo:abstract
  • مثيلة أكسجين ذرة الكربون 2' (بالإنجليزية: 2'-O-methylation)‏هو تعديلٌ شائع للنوكليوسيدات في الرنا تُضاف فيه مجموعة ميثيل إلى هيدروكسيل ذرة الكربون 2' الخاصة بالريبوز، وتنتج عن ذلك مجموعة ميثوكسي. توجد معظم النوكليوسيدات الممثيلة في 2'-O في الرنا الريبوسومي والرنا الصغير النووي ويحدث في المناطق النشطة من الريبوسوم وجسيم التضفير. حاليا، تم تحديد حوالي 1210 مثيلة 2'-O لدى الثدييات وتم إيداعها في قاعدة بيانات RMBase (قاعدة تعديلات الرنا). نُشِرت حديثا طريقة جديدة لتحديد الريبوز الممثيل في 2' بواسطة سلسلة البيانات الضخمة. الطريقة كمية وتحدد جميع التعديلات في تجربة واحدة. (ar)
  • La 2'-O-metilació és una modificació dels nucleòsids de l'ARN, en què s'afegeix un grup metil al grup 2'-hidroxil de la ribosa del nuceòsid. Els nucleòsids que presenten 2'-O-metilació, es troben en regions amb una funció essencial dels ribosomes i de l'espliceosoma. A més a més, la 2'-O-metilació de l'adenosina de l'ARN evita la seva conversió a inosina a causa de l'acció de l'adenosina desaminasa. (ca)
  • 2'-O-methylation is a common nucleoside modification of RNA, where a methyl group is added to the 2' hydroxyl of the ribose moiety of a nucleoside, producing a methoxy group. 2'-O-methylated nucleosides are mostly found in ribosomal RNA and small nuclear RNA and occur in the functionally essential regions of the ribosome and spliceosome. Currently, about 1210 2'-O-methylations (2'-O-Me) have been identified in mammals and yeast and deposited in RMBase (RNA Modification Base) database. Having chemical properties intermediate between RNA and DNA, 2'-O-methylation is presumed to have been one of the reactive group of RNA molecules on early earth that would have given rise to DNA. A novel method, Nm-REP-seq, was developed for enriching ribose methylations by using RNA exoribonuclease (Mycoplasma genitalium RNase R, MgR) and periodate oxidation reactivity to eliminate 2'-hydroxylated (2'-OH) nucleosides. Nm-REP-seq utilizes two orthogonal lines of evidences for the single-nucleotide detection of 2'-O-Methylation sites in various ncRNAs and mRNAs. Nm-REP-seq discovered telomerase RNA component (TERC) RNA, scaRNAs and snoRNAs as new classes of Nm-containing ncRNAs. Furthermore, Nm-REP-seq revealed 2'-O-Methylation located at the 3’-end of snoRNAs, snRNAs, tRNAs and fragments derived from them, as well as piRNAs and miRNAs. A method to map 2'-O ribose methylations by high throughput sequencing has been published. The method maps modifications of rRNAs in a single experiment. (en)
  • La 2’-O-méthylation est une modification courante des ARN consistant à lier un groupe méthyle à l'hydroxyle 2’ d'un résidu du ribose d'un nucléoside, ce qui donne un groupe méthoxy –OCH3. Les nucléosides 2’-O-méthylés se rencontrent principalement dans l'ARN ribosomique et les petits ARN nucléaires et se situent dans les régions essentielles au fonctionnement des ribosomes et des splicéosomes. Il a été proposé que la 2’-O-méthylation ait pu préfigurer l'ADN dans le monde à ARN à l'origine de la vie sur Terre. Il existe des méthodes de séquençage à haut débit pour cartographier les 2’-O-méthylations du ribose de l'ARN. (fr)
  • La 2'-O-metilación es una modificación de los nucleósidos en el ARN, en la cual se añade un grupo metilo al grupo 2'-hidroxilo de la ribosa del nucleósido. Los nucleósidos con 2'-O-metilación se encuentran fundamentalmente en regiones funcionalmente esenciales tanto de los ribosomas como del espliceosoma.​ Además, la 2'-O-metilación de la adenosina en el ARN evita su edición a inosina por parte de la adenosina desaminasa.​ (es)
  • A 2'-O-metilação é uma modificação de nucleosídeos comum que se dá no ARN, na qual se acresce um grupo metilo ao grupo hidroxilo em posição 2' do açúcar ribose de um nucleósideo. Os nucleósideos 2'-O-metilados encontram-se principalmente no ARN ribossomal e no pequeno ARN nuclear e aparecem nas regiões com uma função essencial dos ribossoma e do spliceossoma. Além disso, a 2'-O-metilação da adenosina no ARN impede que a enzima adenosina desaminase a modifique convertendo-a em inosina. Foi publicado recentemente um novo método para mapear as 2'-O-metilações de ribose por sequenciação de alto rendimento. O método é quantitativo e pode mapear todas as modificações numa só experimentação. (pt)
  • 2'-O-甲基化(2′-O-methylation,2′-O-M)是RNA一種常見的核苷修飾,為核苷中核糖2號位的氫氧基被甲基化而形成甲氧基,此修飾常見於rRNA與snRNA中與轉譯和RNA剪切功能相關的位點,且在mRNA、tRNA、snoRNA與siRNA中也有,三域生物與病毒RNA的A、U、C、G四種鹼基中皆有此修飾。目前哺乳類與酵母菌已有超過1200個2'-O-甲基化位點被發現,紀錄於資料庫中。有研究顯示rRNA中的一些2'-O-甲基化位點為部分修飾,意即細胞中只有一部份rRNA在這些位點被修飾,可能是(ribosome heterogeneity)的機制之一。 細胞將RNA特定位點2'-O-甲基化的機制有兩種,一為使用spoUT基因家族的2'-O-甲基轉移酶(2′-O-MTase),二為使用包含snoRNA的C/D匣核糖核蛋白(C/D box RNP),其中snoRNA可幫助選定位點,並非直接作為催化甲基化的核酶。酵母菌中轉錄rRNA的過程會同時將其2'-O-甲基化,且在細胞將45S rRNA切割成18S、5.8S與25S時,中有80%的2'-O-甲基化位點已經被加上修飾。 被2'-O-甲基化的RNA化學性質介於RNA與DNA之間,有假說認為2'-O-甲基化是DNA起源的中間產物,即RNA世界的RNA被2'-O-甲基化後再轉變為DNA。 (zh)
dbo:thumbnail
dbo:wikiPageID
  • 14884904 (xsd:integer)
dbo:wikiPageLength
  • 3701 (xsd:nonNegativeInteger)
dbo:wikiPageRevisionID
  • 1120333211 (xsd:integer)
dbo:wikiPageWikiLink
dbp:wikiPageUsesTemplate
dcterms:subject
gold:hypernym
rdf:type
rdfs:comment
  • مثيلة أكسجين ذرة الكربون 2' (بالإنجليزية: 2'-O-methylation)‏هو تعديلٌ شائع للنوكليوسيدات في الرنا تُضاف فيه مجموعة ميثيل إلى هيدروكسيل ذرة الكربون 2' الخاصة بالريبوز، وتنتج عن ذلك مجموعة ميثوكسي. توجد معظم النوكليوسيدات الممثيلة في 2'-O في الرنا الريبوسومي والرنا الصغير النووي ويحدث في المناطق النشطة من الريبوسوم وجسيم التضفير. حاليا، تم تحديد حوالي 1210 مثيلة 2'-O لدى الثدييات وتم إيداعها في قاعدة بيانات RMBase (قاعدة تعديلات الرنا). نُشِرت حديثا طريقة جديدة لتحديد الريبوز الممثيل في 2' بواسطة سلسلة البيانات الضخمة. الطريقة كمية وتحدد جميع التعديلات في تجربة واحدة. (ar)
  • La 2'-O-metilació és una modificació dels nucleòsids de l'ARN, en què s'afegeix un grup metil al grup 2'-hidroxil de la ribosa del nuceòsid. Els nucleòsids que presenten 2'-O-metilació, es troben en regions amb una funció essencial dels ribosomes i de l'espliceosoma. A més a més, la 2'-O-metilació de l'adenosina de l'ARN evita la seva conversió a inosina a causa de l'acció de l'adenosina desaminasa. (ca)
  • La 2'-O-metilación es una modificación de los nucleósidos en el ARN, en la cual se añade un grupo metilo al grupo 2'-hidroxilo de la ribosa del nucleósido. Los nucleósidos con 2'-O-metilación se encuentran fundamentalmente en regiones funcionalmente esenciales tanto de los ribosomas como del espliceosoma.​ Además, la 2'-O-metilación de la adenosina en el ARN evita su edición a inosina por parte de la adenosina desaminasa.​ (es)
  • 2'-O-甲基化(2′-O-methylation,2′-O-M)是RNA一種常見的核苷修飾,為核苷中核糖2號位的氫氧基被甲基化而形成甲氧基,此修飾常見於rRNA與snRNA中與轉譯和RNA剪切功能相關的位點,且在mRNA、tRNA、snoRNA與siRNA中也有,三域生物與病毒RNA的A、U、C、G四種鹼基中皆有此修飾。目前哺乳類與酵母菌已有超過1200個2'-O-甲基化位點被發現,紀錄於資料庫中。有研究顯示rRNA中的一些2'-O-甲基化位點為部分修飾,意即細胞中只有一部份rRNA在這些位點被修飾,可能是(ribosome heterogeneity)的機制之一。 細胞將RNA特定位點2'-O-甲基化的機制有兩種,一為使用spoUT基因家族的2'-O-甲基轉移酶(2′-O-MTase),二為使用包含snoRNA的C/D匣核糖核蛋白(C/D box RNP),其中snoRNA可幫助選定位點,並非直接作為催化甲基化的核酶。酵母菌中轉錄rRNA的過程會同時將其2'-O-甲基化,且在細胞將45S rRNA切割成18S、5.8S與25S時,中有80%的2'-O-甲基化位點已經被加上修飾。 被2'-O-甲基化的RNA化學性質介於RNA與DNA之間,有假說認為2'-O-甲基化是DNA起源的中間產物,即RNA世界的RNA被2'-O-甲基化後再轉變為DNA。 (zh)
  • 2'-O-methylation is a common nucleoside modification of RNA, where a methyl group is added to the 2' hydroxyl of the ribose moiety of a nucleoside, producing a methoxy group. 2'-O-methylated nucleosides are mostly found in ribosomal RNA and small nuclear RNA and occur in the functionally essential regions of the ribosome and spliceosome. Currently, about 1210 2'-O-methylations (2'-O-Me) have been identified in mammals and yeast and deposited in RMBase (RNA Modification Base) database. (en)
  • La 2’-O-méthylation est une modification courante des ARN consistant à lier un groupe méthyle à l'hydroxyle 2’ d'un résidu du ribose d'un nucléoside, ce qui donne un groupe méthoxy –OCH3. Les nucléosides 2’-O-méthylés se rencontrent principalement dans l'ARN ribosomique et les petits ARN nucléaires et se situent dans les régions essentielles au fonctionnement des ribosomes et des splicéosomes. Il a été proposé que la 2’-O-méthylation ait pu préfigurer l'ADN dans le monde à ARN à l'origine de la vie sur Terre. (fr)
  • A 2'-O-metilação é uma modificação de nucleosídeos comum que se dá no ARN, na qual se acresce um grupo metilo ao grupo hidroxilo em posição 2' do açúcar ribose de um nucleósideo. Os nucleósideos 2'-O-metilados encontram-se principalmente no ARN ribossomal e no pequeno ARN nuclear e aparecem nas regiões com uma função essencial dos ribossoma e do spliceossoma. Além disso, a 2'-O-metilação da adenosina no ARN impede que a enzima adenosina desaminase a modifique convertendo-a em inosina. (pt)
rdfs:label
  • مثيلة 2'-O (ar)
  • 2'-O-metilació (ca)
  • 2'-O-methylation (en)
  • 2'-O-metilación (es)
  • 2'-O-Méthylation (fr)
  • 2'-O-metilação (pt)
  • 2'-O-甲基化 (zh)
owl:sameAs
prov:wasDerivedFrom
foaf:depiction
foaf:isPrimaryTopicOf
is dbo:wikiPageRedirects of
is dbo:wikiPageWikiLink of
is foaf:primaryTopic of
Powered by OpenLink Virtuoso    This material is Open Knowledge     W3C Semantic Web Technology     This material is Open Knowledge    Valid XHTML + RDFa
This content was extracted from Wikipedia and is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License