| dbpprop:abstract
|
- ATG and AUG denote sequences of DNA and RNA respectively that are the start codon or initiation codon encoding the amino acid methionine (Met) in eukaryotes and a modified Met in prokaryotes. The principle called the Central dogma of molecular biology describes the process of translation of a gene to a protein. Specific sequences of DNA act as a template to synthesize mRNA in a process termed "transcription" in the nucleus. This mRNA is exported from the nucleus into the cytoplasm of the cell and acts as a template to synthesize protein in a process called "translation. " Three nucleotide bases specify one amino acid in the genetic code, a mapping encoded in the tRNA of the organism. The first three bases of the coding sequence (CDS) of mRNA to be translated into protein are called a start codon or initiation codon. The start codon is almost always preceded by an untranslated region 5' UTR. The start codon is typically AUG (or ATG in DNA; this also encodes methionine). Very rarely in higher organisms are non AUG start codons used. In addition to AUG, alternative start codons, mainly GUG and UUG are used in prokaryotes. For example E. coli uses 83% ATG (AUG), 14% GTG (GUG), 3% TTG (UUG) and one or two others. Interestingly when an alternative start codon is used, it gets translated as methionine - even if the codon might normally encode a different amino acid. This is because a separate [tRNA] is used for initiation. Well known coding regions that do not have ATG initiation codons are those of lacI (GTG) and lacA (TTG) in the E. coli lac operon.
- Als Startcodon oder Initiatorcodon wird das RNA-Basentriplett AUG bezeichnet, das als erstes Codon eines offenen Leserahmens (ORF) auf der mRNA für die Aminosäure Methionin (Met) in Eukaryoten bzw. für ein modifiziertes Methionin (N-Formylmethionin, fMet) in Prokaryoten codiert. Im genetischen Code kodieren drei Nukleinbasen für eine Aminosäure. Gewöhnlich handelt es sich bei den ersten drei Basen der kodierenden Sequenz der mRNA, die in Protein umgeschrieben wird, um AUG. AUG kodiert für Methionin, und deswegen ist die erste Aminosäure in allen originären Proteinen Methionin; Proteine, die nicht mit Methionin anfangen, wurden enzymatisch aus einem Präprotein gebildet. Dem Startcodon geht fast immer eine untranslatierte Region voraus.
- El codón de inicio de la traducción o codón de inicio es una secuencia de ADN o ARN de tres nucleótidos (es decir, un codón) que indica a la maquinaria celular el lugar en el que comienza la traducción del ARN mensajero. En el genoma se encuentra codificado como «ATG», mientras que, en el ARN mensajero, queda como «AUG». El codón de inicio no sólo es una señal de inicio de la traducción, sino que se traduce de forma efectiva, por lo que, al menos antes de su procesamiento proteolítico, todas las proteínas eucariotas poseen en su extremo amino terminal una metionina, que es el aminoácido correspondiente al codón según el código genético. En procariotas, dicha metionina se encuentra modificada como N-formilmetionina. Lo que no quiere decir que todo los componentes del proteoma posean dicha metionina en su extremo, pues es común que sea escindida enzimáticamente. Si bien AUG es el codón de inicio más empleado en eucariotas, existen otros codones que también son válidos como inicio de la traducción. Dichas excepciones son bastante más comunes en procariotas, donde, como codones alternativos de inicio de la traducción, pueden emplearse GUG y UUG. Por ejemplo, Escherichia coli, una bacteria de la familia Enterobacteriaceae, emplea en un 83% de los casos ATG (AUG en el ARN), GTG en un 14% (GUG en el transcrito) y en un 3% TTG (UUG en el ARN) y aún algún otro.
- Le codon d'initiation ou codon de démarrage est un triplet de nucléotides qui dirige l'initiation de la traduction protéique, il signale le début du message génétique sur un ARNm. Chez les Eucaryotes, ce codon est presque exclusivement le triplet AUG qui code une méthionine (Met). Chez les Procaryotes, le codon d'initiation est également AUG mais peut parfois être remplacé par le codon GUG et plus rarement UUG. Chez Escherichia coli, par exemple, sur 4288 gènes identifiés, 3542 débutent par un AUG, 612 par GUG et 130 par UUG (et 4 cas particuliers ou incertains). Quel que soit le codon d'inititiation utilisé (AUG, GUG ou UUG), le premier acide aminé incorporé est toujours une N-formyl-méthionine (fMet). Il s'agit d'une méthionine dont le groupe aminé est formylé. Sur le brin sens de l'ADN, la séquence du codon d'initiation est ATG. Chez les Eucaryotes, les nucléotides entourant le triplet initiateur ATG sont bien conservés et constituent une séquence nommée séquence consensus de Kozak. Cette séquence est 5’- GCCGCCRCCATGG -3’ où R est soit une adénine soit une guanine, elle permet l'association de l'ARNm sur la petite sous-unité du ribosome. La différenciation entre un triplet initiateur et un triplet codant une méthionine au sein de la chaîne CACA peptidique est favorisée par cette séquence. Chez les Procaryotes la séquence consensus qui permet la fixation de l'ARNm sur la petite sous-unité du ribosome est la séquence consensus de Shine-Dalgarno. La séquence de Shine-Dalgarno (5’- AGGAGG -3’) est située entre 6 et 12 bases en amont du codon AUG de l'ARNm. Comme nous l'avons vu plus haut, la méthionine codée par le codon initiateur est formylée sur le groupement aminé. Il existe donc deux types d'ARNt pour la méthionine selon qu'elle est initiale ou interne. Dans ce dernier cas, elle n'est pas formylée. La méthionine codée par le codon d'initiation est généralement enlevée juste après la synthèse de la chaîne peptidique. Note : l'anglicisme codon start est à éviter dans la mesure où le terme français est largement répandu dans la littérature scientifique francophone.
- 開始コドン(かいしコドン)とは、mRNA上で蛋白質の合成開始を指定するコドンのこと。 真核生物ではほぼAUG(メチオニン)が使われる。つまり、合成する蛋白質に対応するコドンフレームのうち、リボゾーム結合部位(シャイン・ダルガノ配列など)以降最初に現れるAUGが開始コドンである。真正細菌では、GUG(バリン)やAUA(イソロイシン)、UUG(ロイシン)なども開始コドンとして使用する。 AUGはメチオニンをコードするコドンであり、真核生物本体および古細菌ではそのままメチオニンから翻訳が開始される。しかし、真正細菌と真核生物の細胞内小器官(ミトコンドリアや葉緑体)では、開始コドンのAUGのみN-ホルミルメチオニンに対応する。結果としてホルミルメチオニンから翻訳が開始される(途中で出てきたAUGはメチオニンをコードする)。
|
| rdfs:comment
|
- ATG and AUG denote sequences of DNA and RNA respectively that are the start codon or initiation codon encoding the amino acid methionine (Met) in eukaryotes and a modified Met in prokaryotes. The principle called the Central dogma of molecular biology describes the process of translation of a gene to a protein. Specific sequences of DNA act as a template to synthesize mRNA in a process termed "transcription" in the nucleus.
- Als Startcodon oder Initiatorcodon wird das RNA-Basentriplett AUG bezeichnet, das als erstes Codon eines offenen Leserahmens (ORF) auf der mRNA für die Aminosäure Methionin (Met) in Eukaryoten bzw. für ein modifiziertes Methionin (N-Formylmethionin, fMet) in Prokaryoten codiert. Im genetischen Code kodieren drei Nukleinbasen für eine Aminosäure. Gewöhnlich handelt es sich bei den ersten drei Basen der kodierenden Sequenz der mRNA, die in Protein umgeschrieben wird, um AUG.
- El codón de inicio de la traducción o codón de inicio es una secuencia de ADN o ARN de tres nucleótidos (es decir, un codón) que indica a la maquinaria celular el lugar en el que comienza la traducción del ARN mensajero. En el genoma se encuentra codificado como «ATG», mientras que, en el ARN mensajero, queda como «AUG».
- Le codon d'initiation ou codon de démarrage est un triplet de nucléotides qui dirige l'initiation de la traduction protéique, il signale le début du message génétique sur un ARNm. Chez les Eucaryotes, ce codon est presque exclusivement le triplet AUG qui code une méthionine (Met). Chez les Procaryotes, le codon d'initiation est également AUG mais peut parfois être remplacé par le codon GUG et plus rarement UUG.
|