In population genetics, linkage disequilibrium is the non-random association of alleles at two or more loci, not necessarily on the same chromosome. It is not the same as linkage, which describes the association of two or more loci on a chromosome with limited recombination between them.

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  • In population genetics, linkage disequilibrium is the non-random association of alleles at two or more loci, not necessarily on the same chromosome. It is not the same as linkage, which describes the association of two or more loci on a chromosome with limited recombination between them. Linkage disequilibrium describes a situation in which some combinations of alleles or genetic markers occur more or less frequently in a population than would be expected from a random formation of haplotypes from alleles based on their frequencies. Non-random associations between polymorphisms at different loci are measured by the degree of linkage disequilibrium (LD). An example is the prevalence of two rare diseases in Finland: there, compared to elsewhere in Europe, cystic fibrosis is less prevalent but congenital chloride diarrhea is more prevalent. Both diseases are due to mutations on chromosome 7, in adjacent genes. The level of linkage disequilibrium is influenced by a number of factors including genetic linkage, the rate of recombination, the rate of mutation, genetic drift, non-random mating, and population structure. For example, some organisms may show linkage disequilibrium because they reproduce asexually and there is no recombination to break down the linkage disequilibrium.
  • En genética se denomina desequilibrio del ligamiento a la propiedad de algunos genes de las poblaciones genéticas por la cual éstos no segregan de forma independiente, esto es, que poseen una frecuencia de recombinación menor del 50%. Esto suele deberse a que los dos loci implicados se encuentran en el mismo cromosoma, lo que imposibilita su transferencia a la progenie de manera aleatoria con la separación de los cromosomas en anafase.
  • Il linkage disequilibrium (LD) è un termine dell'ambito genetico che indica la presenza di associazione statistica tra specifici alleli relativi a due o più loci, non necessariamente presenti sullo stesso cromosoma, che costituiscono di solito un particolare aplotipo ancestrale, diffuso nella popolazione in cui è rilevato perché trasmesso lungo la discendenza da un comune progenitore. Per questo motivo il linkage disequilibrium è maggiore in popolazioni omogenee, cioè originate da un nucleo di individui fondatori come le popolazioni sarda o finlandese. Infatti le migrazioni recenti generano substruttura e eterogeneità genetica ed aplotipi differenti associati allo stesso tratto tendono ad abbassare i valori di significatività. Il linkage disequilibrium è un importante strumento per individuare regioni cromosomiche di limitata ampiezza in cui si collocano i geni per una data malattia e si avvale dell'analisi molecolare di varianti alleliche che costituiscono aplotipi in pazienti tra loro apparentemente non imparentati. Infatti è prevedibile che pazienti che hanno ereditato lo stesso segmento cromosomico, definito dal medesimo aplotipo, abbiano ereditato anche la stessa mutazione in esso contenuto. Risale agli anni '80, il primo gene mappato con questo approccio: quello della fibrosi cistica in 7q31.2.
  • 連鎖不平衡(れんさふへいこう:Linkage disequilibrium、略称LD)とは生物の集団において、複数の遺伝子座の対立遺伝子または遺伝的マーカー(多型)の間にランダムでない相関が見られる、すなわちそれらの特定の組合せ(ハプロタイプ)の頻度が有意に高くなる集団遺伝学的な現象をいう。それらは一般には同じ染色体上にあって遺伝的連鎖をしているが、連鎖していても連鎖不平衡が見られない場合もあり、また例外的に別の染色体上で見られる場合もある。つまり遺伝的連鎖とは別の(連鎖している場合も含む)現象である。 2つの遺伝子座に関する連鎖不平衡を考え、各対立遺伝子を変数I1 とI2 で表す。連鎖不平衡パラメータδ を次のように定義する: <math>\delta = Cov(I_1, I_2) = p_1 p_2 - h_{12} </math> ここでp1 とp2 は2つの遺伝子座における単独の対立遺伝子の頻度を表し、h12 は両対立遺伝子を合わせたハプロタイプの頻度を表す。この他にも様々なパラメータが用いられている。これが0でない場合に2つの対立遺伝子は連鎖不平衡にあるといい、それに対し δ = 0 の場合を連鎖平衡という。 連鎖不平衡の原因は多くの場合、基本的には遺伝的連鎖にあり、対象とする集団の祖先が持っていた特定のハプロタイプがまだ保存されている場合に連鎖不平衡が見られる。 また集団が複数の遺伝的集団からなる(見かけの単一集団で、まだあまり交雑していない)場合、あるいは特定のハプロタイプが生物の生存や繁殖に有利である場合も原因となり、この場合には異なる染色体上の対立遺伝子が(見かけ上)連鎖不平衡にあることもある。 International HapMap Project により人類集団の連鎖不平衡をオンラインで知ることができる。これらの情報は特に、疾病に及ぼす遺伝的要因の解析に役立つことが期待されている。
  • Em genética populacional, linkage desequilibrium (desequilíbrio de ligação) é a associação não-aleatória de alelos em dois ou mais loci, não necessariamente no mesmo cromossoma. Não é a mesma coisa que linkage, que descreve a associação de dois ou mais loci num cromossoma com recombinação limitada entre eles. O linkage desequilibrium descreve uma situação em que algumas combinações de alelos ou marcadores genéticos ocorrem mais ou menos frequentemente numa população do que era esperado pela formação aleatória de haplótipos a partir de alelos baseados nas suas frequências. Associações não-aleatórias entre polimorfismos am loci diferentes são medidos pelo grau de linkage desequilibrium.
  • Genetikte, bağlantı dengesizliği iki veya daha fazla lokusun alellerin rastgele olmayan birlikteliğidir (bu lokusların aynı kromozomda bulunmayabilir). Bu olgu, genetik bağlantılık ile karıştırılmamalıdır: bu, aynı kromozomda bulunan, aralarında sınırlı oranda rekombinasyon olan iki veya daha fazla lokusun birlikteliğidir. Bağlantı dengesizliğinde bazı alel veya genetik belirteç (marker) kombinasyonları, bu alellerin topluluktaki sıklıklarına bağlı olarak belli haplotiplerin rastgele oluşturmasından beklenen kombinasyonlardan daha sık veya daha ender olarak bulunur. Belli lokuslardaki polimorfizmlerin rasgele olmayan şekilde birliktelikleri onların bağlantı dengesizliği ile ölçülür. Bağlantı dengesizliği genelde genetik bağlantı ve rekombinasyon hızı ile; mutasyon oranı ile; rasgele sürüklenme ve rasgele olmayan çiftleşme ile; ve topluluğun yapısı ile ilişkilidir. Örneğin, bakteri gibi bazı organizmalarda bağlantı dengesizliği görülmesinin nedeni, bunların eşeysiz üremesi, ve bağlantı dengesizliğini bozacak bir rekombinasyon olmamasıdır.
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  • In population genetics, linkage disequilibrium is the non-random association of alleles at two or more loci, not necessarily on the same chromosome. It is not the same as linkage, which describes the association of two or more loci on a chromosome with limited recombination between them.
  • En genética se denomina desequilibrio del ligamiento a la propiedad de algunos genes de las poblaciones genéticas por la cual éstos no segregan de forma independiente, esto es, que poseen una frecuencia de recombinación menor del 50%. Esto suele deberse a que los dos loci implicados se encuentran en el mismo cromosoma, lo que imposibilita su transferencia a la progenie de manera aleatoria con la separación de los cromosomas en anafase.
  • Il linkage disequilibrium (LD) è un termine dell'ambito genetico che indica la presenza di associazione statistica tra specifici alleli relativi a due o più loci, non necessariamente presenti sullo stesso cromosoma, che costituiscono di solito un particolare aplotipo ancestrale, diffuso nella popolazione in cui è rilevato perché trasmesso lungo la discendenza da un comune progenitore.
  • Em genética populacional, linkage desequilibrium (desequilíbrio de ligação) é a associação não-aleatória de alelos em dois ou mais loci, não necessariamente no mesmo cromossoma. Não é a mesma coisa que linkage, que descreve a associação de dois ou mais loci num cromossoma com recombinação limitada entre eles.
  • Genetikte, bağlantı dengesizliği iki veya daha fazla lokusun alellerin rastgele olmayan birlikteliğidir (bu lokusların aynı kromozomda bulunmayabilir). Bu olgu, genetik bağlantılık ile karıştırılmamalıdır: bu, aynı kromozomda bulunan, aralarında sınırlı oranda rekombinasyon olan iki veya daha fazla lokusun birlikteliğidir.
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  • Linkage disequilibrium
  • Desequilibrio de ligamiento
  • Dinastía Chosŏn
  • Linkage disequilibrium
  • 連鎖不平衡
  • Linkage desequilibrium
  • Bağlantı dengesizliği
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