| dbpprop:abstract
|
- GC-content (or guanine-cytosine content), in molecular biology, is the percentage of nitrogenous bases on a DNA molecule which are either guanine or cytosine (from a possibility of four different ones, also including adenine and thymine). This may refer to a specific fragment of DNA or RNA, or that of the whole genome. When it refers to a fragment of the genetic material, it may denote the GC-content of part of a gene (domain), single gene, group of genes (or gene clusters) or even a non-coding region. G (guanine) and C (cytosine) undergo a specific hydrogen bonding whereas A (adenine) bonds specifically with T (thymine). The GC pair is bound by three hydrogen bonds, while AT pairs are bound by two hydrogen bonds. DNA with high GC-content is more stable than DNA with low GC-content, but contrary to popular belief, the hydrogen bonds do not stabilize the DNA significantly and stabilization is mainly due to stacking interactions. In spite of the higher thermostability conferred to the genetic material, it is envisaged that cells with DNA with high GC-content undergo autolysis, thereby reducing the longevity of the cell per se. Due to the robustness endowed to the genetic materials in high GC organisms it was commonly believed that the GC content played a vital part in adaptation temperatures, a hypothesis which has recently been refuted. In PCR experiments, the GC-content of primers are used to predict their annealing temperature to the template DNA. A higher GC-content level indicates a higher melting temperature.
- Der GC-Gehalt ist ein Merkmal von DNA-Molekülen und gibt den Anteil der DNA-Basen Guanin und Cytosin an der Gesamtheit der Basen in Prozent an. Es gilt: GC-Gehalt in Prozent = (G+C)/(G+C+A+T) · 100 Einem GC-Gehalt von beispielsweise 64% entspricht somit ein AT-Gehalt von 36%.
- En biologia molecular, el contingut GC (o contingut en guanina-citosina) és el percentatge de bases nitrogenades d'una molècula d'ADN que són o bé guanina o bé citosina. Es pot referir a un fragment específic d'ADN o ARN, o al del genoma sencer. Quan es refereix a un fragment del material genètic, pot representar el contingut GC de part d'un gen (domini), un gen, un grup de gens, o fins i tot una regió no codificant. G (guanina) i C (citosina) tenen un enllaç d'hidrogen específic, mentre que A (adenina) s'uneix específicament amb T (timina).
- Obsah GC či množství GC (z anglického GC-content) je podíl nukleových bází guaninu (G) a cytosinu (C) v rámci určité DNA nebo DNA. Zbylými bázemi jsou adenin (A) a thymin (T), jejichž zastoupení v daném genomu logicky činí zbytek do sta procent. Podíl GC vazeb však standardně bývá vyšší než podíl AT vazeb. Guanin se váže na cytosin, podobně jako adenin na thymin. Vazba mezi G a C má tři vodíkové vazby (na rozdíl od AT vazby, která má dvě), díky čemuž je GC vazba odolnější vůči vysoké teplotě. Dříve se kvůli tomu mělo za to, že vyšší obsah GC mají termofilní organismy, což bylo v nedávné době vyvráceno.
- En genética, GC, Contenido GC o Porcentaje GC es una característica del genoma de un organismo o de cualquier pedazo de ADN o ARN. G y C denotan guanina y citosina, respectivamente. Expresado generalmente como porcentaje, representa la cantidad de pares Guanina-Citosina en la molécula de ADN o genoma que está siendo investigado. La fracción restante de cualquier molécula de ADN contendrá bases A y T, de forma que el contenido GC da también el contenido AT (por ejemplo, un GC del 58% implica un contenido AT del 42%). Los pares GC en el ADN están conectados por tres enlaces de hidrógeno en vez de dos de los pares AT. Esto hace el enlace GC más fuerte y más resistente a la desnaturalización por efecto de la temperatura por lo que el contenido GC tiende así a ser mayor en los hipertermófilos. El contenido GC se utiliza a veces para clasificar organismos en taxonomía. Por ejemplo, las Actinobacteria se caracterizan por ser “bacterias de GC alto”. En Streptomyces coelicolor el GC es del 72%, en la levadura Saccharomyces cerevisiae del 38%, mientras que en el organismo modelo Arabidopsis thaliana es del 36%. Debido a la naturaleza del código genético, es virtualmente imposible para que un organismo tenga un genoma con un contenido GC que se acerque al 0% o a 100%. Una especie con un GC extremadamente bajo es Plasmodium falciparum (GC ~20%), y en estos casos es generalmente común referirlos como AT altos en vez de GC bajos. En una sección larga de la secuencia genómica, los genes se caracterizan a menudo por un GC más alto comparado con el genoma entero. Particularmente, los exones son genes con GC alto, mientras que los intrones tienen generalmente AT alto (GC bajo). Más generalmente, muchos estudios han buscado (y encontrado) patrones de la variación de GC a través de una secuencia genómica (abarcando ambas regiones, génicas e intragénicas que las separan). La función y significado de tal variación es confusa. En experimentos con la reacción en cadena de la polimerasa, el GC del partidor se utiliza para determinar los patrones de temperatura. Un GC más alto implica una temperatura de desnaturalización más alta. El GC se puede medir por varios métodos, siendo uno de los más simples la temperatura de desnaturalización de la doble hélice del ADN con un espectrofotómetro. La respuesta del ADN a en la longitud de onda de 260 nm aumenta bastante abrupta cuando la doble hélice se separa en dos las dos hebras cuando se calienta suficientemente. Alternativamente, si la molécula ADN o ARN ha sido secuenciada entonces el GC se puede obtener exactamente contando el número de bases.
- Le Taux de GC (ou pourcentage de GC, ou coefficient de Chargaff) d'une séquence d'ADN est défini comme la proportion de bases de cette séquence étant soit une cytosine (C), soit une guanine (G). Il existe deux bases azotées supplémentaires, l'adénine (A) et la thymine (T), rentrant dans la composition de l'ADN. De plus, la cytosine est toujours liée à la guanine, et l'adénine est toujours liée à la thymine. Ainsi, le taux de GC exprime aussi le pourcentage de liaisons G-C dans la molécule d'ADN.
- Хімічна структура ДНК, що показує як пари AT, так і пари GC У генетиці, вміст цитозину і гуаніну (часто скорочується як «вміст ГЦ» або «вміст GC», іноді навіть як GC%) — характеристика геному будь-якого даного організма або будь-якого іншого шматка ДНК або РНК. Зазвичай цей вміст виражається як відсоток, пропорція GC-пар основ в послідовності ДНК (РНК) молекули або генома, що розглядається. Тут G (або Г) означає гіанін, а C (або Ц) означає цитозин. Решта молекули ДНК складається з основ A і T, таким чином, що в сумі вмісти всіх цих нуклеотидів дають 100 %, (наприклад 58 % вмісту GC = 42 % вмісту AT). Пари GC в ДНК з'єднані трьома водневими зв'язками замість двох у парах AT. Це робить пару GC міцнішою і стійкішою до денатурації при високих температкрах, і тому вміст GC прагне бути більше у термофілів. Вміст GC іноді використовується, щоб класифікувати організм. Наприклад, Actinobacteria характеризується як «бактерія з високим вмістом GC». У Streptomyces coelicolor він складає 72 %. Вміст CG дріжджів складає 38 %, а у іншого загального модельного організму, резуховидки Таля (Arabidopsis thaliana) він складає 36 %. Із-за природи генетичного коду, фактично неможливо для організму мати геном з вмістом GC близьким до 0 %, або 100 %. Видом з надзвичайно низьким вмістом GC є Plasmodium falciparum (GC% = ~20 %). Такі організми звичайно називаються багатими на AT, а не бідними на GC, і навпаки. В межах довгого регіону послідовності генома, гени часто характеризуються іншим вмістом GC ніж решта геному. Зокрема, ексони звичайно багаті на GC, тоді як інтрони звичайно багаті на AT. Детальніші дослідження виявили певний розподіл багатих і бідних на GC районів ДНК, хоча функція і значення такої варіації неясна. У PCR-експериментах, температура плавління примерів залежить від їх вмісту GC, більш високий вміст GC означає більш високу температуру плавлення. Вміст GC бути виміряний декількома засобами але один з найпростіших методів — вимірювання температури плавлення ДНК за допомогою спектрофотометра. На довжині хвилі 260 нм поглинання гостро збільшується, коли дво-ланцюжкова ДНА розпадається на окремі ланцюжки при підвищенні температури. Альтернативно, якщо молекула ДНК або РНК секвентується у процесі дослідження, вміст GC може бути точно обчислений простою арифметикою.
- GC含量是在所研究的对象（例如放线菌）的全基因组中，（鸟嘌呤）（Guanine）和胞嘧啶（Cytosine）所占的比例。一种生物的基因組或特定DNA、RNA片段有特定的GC含量。 在DNA链中G和C是以三个氢键相连，而T和A则是两个氢键相连的。氢键的多少体现连接的能量，氢键多的不容易被打断。 测定GC含量的方法有：Tm法，HPLC法
|
| rdfs:comment
|
- GC-content (or guanine-cytosine content), in molecular biology, is the percentage of nitrogenous bases on a DNA molecule which are either guanine or cytosine (from a possibility of four different ones, also including adenine and thymine). This may refer to a specific fragment of DNA or RNA, or that of the whole genome.
- Der GC-Gehalt ist ein Merkmal von DNA-Molekülen und gibt den Anteil der DNA-Basen Guanin und Cytosin an der Gesamtheit der Basen in Prozent an. Es gilt: GC-Gehalt in Prozent = (G+C)/(G+C+A+T) · 100 Einem GC-Gehalt von beispielsweise 64% entspricht somit ein AT-Gehalt von 36%.
- En biologia molecular, el contingut GC (o contingut en guanina-citosina) és el percentatge de bases nitrogenades d'una molècula d'ADN que són o bé guanina o bé citosina. Es pot referir a un fragment específic d'ADN o ARN, o al del genoma sencer. Quan es refereix a un fragment del material genètic, pot representar el contingut GC de part d'un gen (domini), un gen, un grup de gens, o fins i tot una regió no codificant.
- Obsah GC či množství GC (z anglického GC-content) je podíl nukleových bází guaninu (G) a cytosinu (C) v rámci určité DNA nebo DNA. Zbylými bázemi jsou adenin (A) a thymin (T), jejichž zastoupení v daném genomu logicky činí zbytek do sta procent. Podíl GC vazeb však standardně bývá vyšší než podíl AT vazeb. Guanin se váže na cytosin, podobně jako adenin na thymin.
- En genética, GC, Contenido GC o Porcentaje GC es una característica del genoma de un organismo o de cualquier pedazo de ADN o ARN. G y C denotan guanina y citosina, respectivamente. Expresado generalmente como porcentaje, representa la cantidad de pares Guanina-Citosina en la molécula de ADN o genoma que está siendo investigado.
- Le Taux de GC (ou pourcentage de GC, ou coefficient de Chargaff) d'une séquence d'ADN est défini comme la proportion de bases de cette séquence étant soit une cytosine (C), soit une guanine (G). Il existe deux bases azotées supplémentaires, l'adénine (A) et la thymine (T), rentrant dans la composition de l'ADN. De plus, la cytosine est toujours liée à la guanine, et l'adénine est toujours liée à la thymine.
- GC含量是在所研究的对象（例如放线菌）的全基因组中，（鸟嘌呤）（Guanine）和胞嘧啶（Cytosine）所占的比例。一种生物的基因組或特定DNA、RNA片段有特定的GC含量。 在DNA链中G和C是以三个氢键相连，而T和A则是两个氢键相连的。氢键的多少体现连接的能量，氢键多的不容易被打断。 测定GC含量的方法有：Tm法，HPLC法
|
![[RDF Data]](/statics/sw-cube.png)
