The Bioclipse project is a Java-based, open source, visual platform for chemo- and bioinformatics based on the Eclipse Rich Client Platform (RCP). Bioclipse uses, as any RCP application, a plugin architecture that inherits basic functionality and visual interfaces from Eclipse, such as help system, software updates, preferences, cross-platform deployment etc.

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  • The Bioclipse project is a Java-based, open source, visual platform for chemo- and bioinformatics based on the Eclipse Rich Client Platform (RCP). Bioclipse uses, as any RCP application, a plugin architecture that inherits basic functionality and visual interfaces from Eclipse, such as help system, software updates, preferences, cross-platform deployment etc. Via these plugins, Bioclipse provides functionality for chemo- and bioinformatics, and extension points that easily can be extended by other, possibly proprietary, plugins to provide additional functionality. The first stable release of Bioclipse includes a CDK plugin to provide a chemoinformatic backend, a Jmol plugin for 3D-visualization, and a BioJava plugin for sequence analysis. Bioclipse is developed as a collaboration between the Proteochemometric Group, Dept. of Pharmaceutical Biosciences, Uppsala University, Sweden, the Steinbeck Group at the EBI, and the Analytical Chemistry Department at Leiden University, but includes extensions developed at other academic institutes too.
  • Bioclipse est un projet développé en Java et open source. Il s'agit d'une plate-forme de visualisation pour la chemo- et la bio-informatique basée sur la plateforme client riche [Eclipse_(logiciel) | Eclipse]. Bioclipse utilise une architecture à base de plugins qui hérite des fonctionnalités de base et des interfaces graphiques d'Eclipse, tels que le système d'aide, l'interface de mise à jour du logiciel, la gestion des préférences, le déployement multiplate-forme, etc. Grâce à ces plugins, Bioclipse fournit de nombreuses fonctions pour la chémo- et la bio-informatique, et propose des possibilités d'extension qui permettent d'ajouter facilement de nouvelles fonctionnalités. La première version stable de Bioclipse inclut un plugin CDK (back-end de chemo-informatique), un plugin Jmol pour la visualisation 3D et un plugin BioJava pour l'analyse de séquences. Bioclipse est développé par un consortium de laboratoires : Proteochemometric Group Chemoinformatics and Metabolism Team Division of Analytical Biosciences Ces développements ont été enrichies par de nombreuses contributions d'autres laboratoires académiques.
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  • Bioclipse est un projet développé en Java et open source. Il s'agit d'une plate-forme de visualisation pour la chemo- et la bio-informatique basée sur la plateforme client riche [Eclipse_(logiciel) | Eclipse]. Bioclipse utilise une architecture à base de plugins qui hérite des fonctionnalités de base et des interfaces graphiques d'Eclipse, tels que le système d'aide, l'interface de mise à jour du logiciel, la gestion des préférences, le déployement multiplate-forme, etc.
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