Amplified fragment length polymorphism PCR (or AFLP-PCR or just AFLP) is a PCR-based tool used in genetics research, DNA fingerprinting, and in the practice of genetic engineering. Developed in the early 1990’s by Keygene, AFLP uses restriction enzymes to cut genomic DNA, followed by ligation of adaptors to the sticky ends of the restriction fragments.

PropertyValue
dbpedia-owl:thumbnail
dbpprop:abstract
  • Amplified fragment length polymorphism PCR (or AFLP-PCR or just AFLP) is a PCR-based tool used in genetics research, DNA fingerprinting, and in the practice of genetic engineering. Developed in the early 1990’s by Keygene, AFLP uses restriction enzymes to cut genomic DNA, followed by ligation of adaptors to the sticky ends of the restriction fragments. A subset of the restriction fragments are then amplified using primers complementary to the adaptor and part of the restriction site fragments (as described in detail below). The amplified fragments are visualized on denaturing polyacrylamide gels either through autoradiography or fluorescence methodologies. AFLP-PCR is a highly sensitive method for detecting polymorphisms in DNA. The technique was originally described by Vos and Zabeau in 1993. In detail, the procedure of this technique is divided into three steps: Digestion of total cellular DNA with one or more restriction enzymes and ligation of restriction half-site specific adaptors to all restriction fragments. Selective amplification of some of these fragments with two PCR primers that have corresponding adaptor and restriction site specific sequences. Electrophoretic separation of amplicons on a gel matrix, followed by visualisation of the band pattern. A variation on AFLP is cDNA-AFLP, which is used to quantify differences in gene expression levels. Another variation on AFLP is TE Display, used to detect transposable element mobility.
  • Als AFLP (Abk. für engl. amplified fragment-length polymorphism) wird in der Molekularbiologie eine Technik bezeichnet, mit der ein Genetischen Fingerabdruck erstellt werden kann. Bei der AFLP wird die DNA durch zwei Restriktionsenzyme in Fragmente zerschnitten. Danach werden mit Hilfe zweier Polymerase-Kettenreaktionen einige Fragmente vervielfältigt. Durch Unterschiede in der Anzahl der Restriktions-Schnittstellen entstehen verschieden lange Fragmente, deren Muster auf einem Elektrophorese-Gel zur Unterscheidung von Individuen und auch zur Darstellung naher Verwandtschaften genutzt werden kann. Die AFLP-Technik wurde 1995 durch die Arbeitsgruppe von Pieter Vos entwickelt.
  • AFLP (acronyme anglais de amplified fragment-length polymorphism) est un outil utilisé en génétique et en transgénèse.
  • Amplification Fragment Length Polymorphism (AFLP®) is een identificatietechniek om het genoom van bacteriën en fagen en alle andere denkbare organismen van elkaar te kunnen onderscheiden en genotyperen. Er wordt gebruik gemaakt van willekeurig gekozen primers die goede resultaten blijken te geven. De techniek is ontwikkeld en gepatenteerd door Keygene N.V. Het is een combinatie van een restrictie/ligatie-reactie met een polymerase chain reaction. Na het isoleren van het DNA uit het staal wordt het DNA in stukjes geknipt met restrictie-enzymes. Tegelijkertijd worden stukjes kunstmatig gesynthetiseerd DNA (adapters) aan deze knipplaatsen geligeerd. Voor de daaropvolgende PCR-reactie worden primers toegevoegd die de adaptersequentie herkennen. De DNA-fragmenten worden samen met de adapters vermenigvuldigd in de PCR-reactie. Men kan het aantal geamplificeerde restrictie-fragmenten regelen door aan de primers één of meerdere extra nucleotiden toe te voegen. Voor eenvoudige genomen zoals die van fagen worden primers zonder overhang gebruikt, zodat alle verkregen restrictie-fragmenten geamplificeerd worden. Uiteindelijk kan de detectie van de geamplificeerde fragmenten gebeuren door capillair-elektroforese. Hierbij worden de fragmenten gescheiden tijdens migratie door een polymeer in een capillair. De eigenlijke detectie gebeurt met een laserstraal die de fluorescentie van de fluorescerend-gemerkte primers meet. Aan elk AFLP-product wordt een interne standaard toegevoegd zodat de lengte van de fragmenten kan berekend worden. Een andere methode van scheiden van fragmenten maakt gebruik van een polymere gel matrix waar de (radioactief) gelabelde monsters dmv een elektrische stroom doorheen worden getrokken. Detectie gebeurt dan door de hele gel te belichten tegen een fotografische plaat of een scanner die gevoelig is voor de radioactieve of fluorescerende signalen.
  • Ме́тод поліморфі́зму довжини́ ампліфіко́ваних фрагме́нтів — (англ. AFLP, amplified fragment length polymorphism)— це молекулярно-генетичний метод, головним призначення якого є ідентифікація організмів. AFLP аналіз використовується для створення фінгерпринту бактеріального геному.
dbpprop:hasPhotoCollection
dbpprop:reference
rdfs:comment
  • Amplified fragment length polymorphism PCR (or AFLP-PCR or just AFLP) is a PCR-based tool used in genetics research, DNA fingerprinting, and in the practice of genetic engineering. Developed in the early 1990’s by Keygene, AFLP uses restriction enzymes to cut genomic DNA, followed by ligation of adaptors to the sticky ends of the restriction fragments.
  • Als AFLP (Abk. für engl. amplified fragment-length polymorphism) wird in der Molekularbiologie eine Technik bezeichnet, mit der ein Genetischen Fingerabdruck erstellt werden kann. Bei der AFLP wird die DNA durch zwei Restriktionsenzyme in Fragmente zerschnitten. Danach werden mit Hilfe zweier Polymerase-Kettenreaktionen einige Fragmente vervielfältigt.
  • AFLP (acronyme anglais de amplified fragment-length polymorphism) est un outil utilisé en génétique et en transgénèse.
  • Amplification Fragment Length Polymorphism (AFLP®) is een identificatietechniek om het genoom van bacteriën en fagen en alle andere denkbare organismen van elkaar te kunnen onderscheiden en genotyperen. Er wordt gebruik gemaakt van willekeurig gekozen primers die goede resultaten blijken te geven. De techniek is ontwikkeld en gepatenteerd door Keygene N.V. Het is een combinatie van een restrictie/ligatie-reactie met een polymerase chain reaction.
  • Ме́тод поліморфі́зму довжини́ ампліфіко́ваних фрагме́нтів — (англ. AFLP, amplified fragment length polymorphism)— це молекулярно-генетичний метод, головним призначення якого є ідентифікація організмів. AFLP аналіз використовується для створення фінгерпринту бактеріального геному.
rdfs:label
  • Amplified fragment length polymorphism
  • AFLP
  • Amplified fragment-length polymorphism
  • Amplification fragment length polymorphism
  • Поліморфізм довжини ампліфікованих фрагментів
owl:sameAs
skos:subject
foaf:depiction
foaf:page
is dbpprop:redirect of