U2 spliceosomal snRNAs are a species of small nuclear RNA (snRNA) molecules found in the major spliceosomal (Sm) machinery of virtually all eukaryotic organisms. In vivo, U2 snRNA along with its associated polypeptides assemble to produce the U2 small nuclear ribonucleoprotein (snRNP), an essential component of the major spliceosomal complex. The major spliceosomal-splicing pathway is occasionally referred to as U2 dependent, based on a class of Sm intron—found in mRNA primary transcripts—that are recognized exclusively by the U2 snRNP during early stages of spliceosomal assembly. In addition to U2 dependent intron recognition, U2 snRNA has been theorized to serve a catalytic role in the chemistry of pre-RNA splicing as well. Similar to ribosomal RNAs (rRNAs), Sm snRNAs must mediate both R
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| - ARNsn U2 (fr)
- U2 snRNA (ja)
- U2 spliceosomal RNA (en)
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| - L’ARNsn U2 est un petit ARN nucléaire (snRNA) entrant dans la composition des petites ribonucléoprotéines nucléaires U2, composants du splicéosome impliqué dans la maturation du pré-ARNm. La complémentarité obligatoire entre ARNsn U2 et l'intron est la présence, sur la boite de branchement, d'un renflement portant une adénosine non appariée qui initie une attaque nucléophile du site d'épissage 5' de l'intron, déclenchant ainsi la première des deux réactions de transestérification qui interviennent dans l'épissage. (fr)
- U2 spliceosomal snRNAs are a species of small nuclear RNA (snRNA) molecules found in the major spliceosomal (Sm) machinery of virtually all eukaryotic organisms. In vivo, U2 snRNA along with its associated polypeptides assemble to produce the U2 small nuclear ribonucleoprotein (snRNP), an essential component of the major spliceosomal complex. The major spliceosomal-splicing pathway is occasionally referred to as U2 dependent, based on a class of Sm intron—found in mRNA primary transcripts—that are recognized exclusively by the U2 snRNP during early stages of spliceosomal assembly. In addition to U2 dependent intron recognition, U2 snRNA has been theorized to serve a catalytic role in the chemistry of pre-RNA splicing as well. Similar to ribosomal RNAs (rRNAs), Sm snRNAs must mediate both R (en)
- U2 snRNA（U2 small nuclear RNA）は、事実上すべての真核生物のメジャースプライソソーム（Sm）に存在するsnRNAの一種である。In vivoでは、U2 snRNAは関連ポリペプチドとともに組み立てられてU2 snRNPを形成する。U2 snRNPはメジャースプライソソーム複合体の必須の構成要素である。メジャースプライソソームによるスプライシング経路はU2依存的経路と呼ばれることもあるが、それは一次転写産物に存在するSmイントロンはスプライソソームの組み立ての初期段階において、専らU2 snRNPによって認識されるためである。イントロンの認識に加えて、U2 snRNAはpre-RNAのスプライシング反応の触媒にも関与すると考えられている。リボソームRNAと同様に、SmクラスのsnRNAはRNA-RNA間相互作用とRNA-タンパク質間相互作用の双方を媒介しなければならず、これらのタイプの相互作用を促進するため特殊化し高度に保存された一次・二次構造エレメントを進化させている。 (ja)
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| - Predicted secondary structure and sequence conservation of U2 (en)
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| - L’ARNsn U2 est un petit ARN nucléaire (snRNA) entrant dans la composition des petites ribonucléoprotéines nucléaires U2, composants du splicéosome impliqué dans la maturation du pré-ARNm. La complémentarité obligatoire entre ARNsn U2 et l'intron est la présence, sur la boite de branchement, d'un renflement portant une adénosine non appariée qui initie une attaque nucléophile du site d'épissage 5' de l'intron, déclenchant ainsi la première des deux réactions de transestérification qui interviennent dans l'épissage. (fr)
- U2 spliceosomal snRNAs are a species of small nuclear RNA (snRNA) molecules found in the major spliceosomal (Sm) machinery of virtually all eukaryotic organisms. In vivo, U2 snRNA along with its associated polypeptides assemble to produce the U2 small nuclear ribonucleoprotein (snRNP), an essential component of the major spliceosomal complex. The major spliceosomal-splicing pathway is occasionally referred to as U2 dependent, based on a class of Sm intron—found in mRNA primary transcripts—that are recognized exclusively by the U2 snRNP during early stages of spliceosomal assembly. In addition to U2 dependent intron recognition, U2 snRNA has been theorized to serve a catalytic role in the chemistry of pre-RNA splicing as well. Similar to ribosomal RNAs (rRNAs), Sm snRNAs must mediate both RNA:RNA and RNA:protein contacts and hence have evolved specialized, highly conserved, primary and secondary structural elements to facilitate these types of interactions. Shortly after the discovery that mRNA primary transcripts contain long, non-coding intervening sequences (introns) by Sharp and Roberts, Joan Steitz began work to characterize the biochemical mechanism of intron excision. The curious observation that a sequence found in the 5´ region of the U1 snRNA exhibited extensive base pairing complementarity with conserved sequences across 5´ splice junctions in hnRNA transcripts prompted speculation that certain snRNAs may be involved in recognizing splice site boundaries through RNA:RNA contacts. Only recently have atomic crystal structures revealed demonstrably that the original conjecture was indeed correct, even if the complexity of these interactions were not fully realized at the time. (en)
- U2 snRNA（U2 small nuclear RNA）は、事実上すべての真核生物のメジャースプライソソーム（Sm）に存在するsnRNAの一種である。In vivoでは、U2 snRNAは関連ポリペプチドとともに組み立てられてU2 snRNPを形成する。U2 snRNPはメジャースプライソソーム複合体の必須の構成要素である。メジャースプライソソームによるスプライシング経路はU2依存的経路と呼ばれることもあるが、それは一次転写産物に存在するSmイントロンはスプライソソームの組み立ての初期段階において、専らU2 snRNPによって認識されるためである。イントロンの認識に加えて、U2 snRNAはpre-RNAのスプライシング反応の触媒にも関与すると考えられている。リボソームRNAと同様に、SmクラスのsnRNAはRNA-RNA間相互作用とRNA-タンパク質間相互作用の双方を媒介しなければならず、これらのタイプの相互作用を促進するため特殊化し高度に保存された一次・二次構造エレメントを進化させている。 mRNA一次転写産物のタンパク質コード領域がタンパク質をコードしない長い配列（イントロン）によって分割されていることがフィリップ・シャープとリチャード・ロバーツによって発見された直後、はイントロン除去の生化学的機構の特徴づけに取り掛かった。興味深いことに、U1 snRNAの5'領域に見られる配列がhnRNA転写産物の5'スプライスジャンクションの保存配列と広範囲にわたって塩基対の相補性を示すことが観察され、ある種のsnRNAがRNA-RNA間相互作用を介してスプライス部位の境界の認識に関与している可能性が推測された。これらの相互作用の複雑さは当時はまだ十分に理解されていなかったが、近年になって原子分解能の結晶構造が明らかとなり、当初の予想が実際に正しかったことが実証された。 (ja)
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