About: Needleman–Wunsch algorithm     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : yago:WikicatAlgorithmsOnStrings, within Data Space : dbpedia.org associated with source document(s)
QRcode icon
http://dbpedia.org/describe/?url=http%3A%2F%2Fdbpedia.org%2Fresource%2FNeedleman%E2%80%93Wunsch_algorithm

The Needleman–Wunsch algorithm is an algorithm used in bioinformatics to align protein or nucleotide sequences. It was one of the first applications of dynamic programming to compare biological sequences. The algorithm was developed by Saul B. Needleman and Christian D. Wunsch and published in 1970. The algorithm essentially divides a large problem (e.g. the full sequence) into a series of smaller problems, and it uses the solutions to the smaller problems to find an optimal solution to the larger problem. It is also sometimes referred to as the optimal matching algorithm and the global alignment technique. The Needleman–Wunsch algorithm is still widely used for optimal global alignment, particularly when the quality of the global alignment is of the utmost importance. The algorithm assign

AttributesValues
rdf:type
rdfs:label
  • Algorisme de Needleman-Wunsch (ca)
  • Needlemanův–Wunschův algoritmus (cs)
  • Needleman-Wunsch-Algorithmus (de)
  • Αλγόριθμος Νίντλμαν-Βουνς (el)
  • Algoritmo Needleman-Wunsch (es)
  • Algorithme de Needleman-Wunsch (fr)
  • Needleman–Wunsch algorithm (en)
  • Algoritmo Needleman-Wunsch (pt)
  • Algorytm Needlemana-Wunscha (pl)
  • Алгоритм Нидлмана — Вунша (ru)
  • 尼德曼-翁施算法 (zh)
  • Алгоритм Нідлмана — Вунша (uk)
rdfs:comment
  • L'algorisme de Needleman–Wunsch és un algorisme àmpliament utilitzat en bioinformàtica per a l'alineament global de seqüències proteiques o nucleotídiques. L'algorisme va ser proposar per primera per i el 1970. L'algorisme de Needleman–Wunsch és un exemple de programació dinàmica i es considera la primera aplicació de programació dinàmica en la comparació de seqüències biològiques. (ca)
  • Needlemanův-Wunschův algoritmus je jedním ze základních algoritmů bioinformatiky. Provádí globální zarovnání sekvencí (tedy takové, ve kterém je v každé části zarovnání brán ohled na celou sekvenci) dovolující mezery, nejčastěji jde o sekvence nukleotidů v nukleových kyselinách či sekvence aminokyselin v proteinech. Jde o algoritmus dynamického programování, je to první algoritmus tohoto druhu použitý pro srovnávání biologických sekvencí. Byl sestaven v roce 1970 Saulem B. Needlemanem a Christianem D. Wunschem. (cs)
  • Ο αλγόριθμος Νίντλμαν-Βουνς (Needleman-Wunsch) είναι ένας αλγόριθμος που χρησιμοποιείται για ολική στοίχιση ακολουθιών. Συγκεκριμένα χρησιμοποιείται για να υπολογιστεί η βέλτιστη ολική στοίχιση μεταξύ δύο ακολουθιών - συμβολοσειρών, μια διαδικασία ιδιαίτερα χρήσιμη σε διάφορους τομείς, όπως για παράδειγμα στη βιοπληροφορική. Ο συγκεκριμένος αλγόριθμος ανήκει στη φιλοσοφία αλγορίθμων δυναμικού προγραμματισμού. (el)
  • Algorytm Needlemana-Wunscha – algorytm oparty na programowaniu dynamicznym, umożliwiający znalezienie optymalnego globalnego dopasowania dwóch sekwencji. Jest często wykorzystywany w bioinformatyce jako jedno z narzędzi do poszukiwania uliniowienia sekwencji nukleotydowych lub aminokwasowych. Został stworzony przez Saul B. Needleman’a i Christian D. Wunsch’a oraz opublikowany w roku 1970. Dzieli on większy problem obliczeniowy (np. całą sekwencję) na mniejsze problemy, i używa rozwiązań mniejszych problemów do znalezienia optymalnego rozwiązania dużego problemu. (pl)
  • Алгоритм Нидлмана — Вунша — это алгоритм для выполнения выравнивания двух последовательностей (будем называть их и ), который используется в биоинформатике при построении выравниваний аминокислотных или нуклеотидных последовательностей. Алгоритм был предложен в 1970 году и . Алгоритм Нидлмана — Вунша является примером динамического программирования, и он оказался первым примером приложения динамического программирования к сравнению биологических последовательностей. (ru)
  • 尼德曼-翁施算法(英語:Needleman-Wunsch Algorithm)是基于生物信息学的知识来匹配蛋白序列或者DNA序列的算法。这是将动态算法应用于生物序列的比较的最早期的几个实例之一。该算法是由 Saul B. Needlman和 Christian D. Wunsch 两位科学家于1970年发明的。本算法高效地解决了如何将一个庞大的数学问题分解为一系列小问题,并且从一系列小问题的解决方法重建大问题的解决方法的过程。该算法也被称为优化匹配算法和整体序列比较法。时至今日尼德曼-翁施算法仍然被广泛应用于优化整体序列比较中。 (zh)
  • Der Needleman-Wunsch-Algorithmus ist ein Optimierungsalgorithmus aus der Bioinformatik. Dort wird er zum Vergleich zweier Nukleotid- bzw. Aminosäuresequenzen eingesetzt. Er berechnet anhand eines Modells den optimalen globalen Similarity-Score bzw. mit Hilfe von Backtracking ein oder mehrere optimale globale Alignments zwischen zwei Sequenzen. Der Similarity-Score ist ein Maß für die Ähnlichkeit zweier Sequenzen; je höher der Score, umso ähnlicher sind die Sequenzen unter dem angewendeten Scoring-Modell. Der Algorithmus optimiert den Score des Alignments. Dabei ist ein Alignment eine Folge von Editierschritten, um die erste Sequenz in die zweite zu überführen. Für zwei nichttriviale Sequenzen gibt es viele Alignments – ein optimales Alignment hat einen maximalen Similarity-Score. Der Algor (de)
  • El algoritmo de Needleman-Wunsch sirve para realizar alineamientos globales de dos secuencias. Se suele utilizar en el ámbito de la bioinformática para alinear secuencias de proteínas o de ácidos nucleicos.Fue propuesto por primera vez en 1970, por Saul Needleman y Christian Wunsch. Se trata de un ejemplo típico deprogramación dinámica. El algoritmo funciona del mismo modo independientemente de la complejidad o longitud de las secuencias y garantiza la obtención del mejor alineamiento.​ Por ejemplo podemos definir la siguiente matriz: Y entonces el siguiente alineamiento: AGACTAGTTACCGA---GACGT (es)
  • The Needleman–Wunsch algorithm is an algorithm used in bioinformatics to align protein or nucleotide sequences. It was one of the first applications of dynamic programming to compare biological sequences. The algorithm was developed by Saul B. Needleman and Christian D. Wunsch and published in 1970. The algorithm essentially divides a large problem (e.g. the full sequence) into a series of smaller problems, and it uses the solutions to the smaller problems to find an optimal solution to the larger problem. It is also sometimes referred to as the optimal matching algorithm and the global alignment technique. The Needleman–Wunsch algorithm is still widely used for optimal global alignment, particularly when the quality of the global alignment is of the utmost importance. The algorithm assign (en)
  • L'algorithme de Needleman-Wunsch est un algorithme qui effectue un alignement global maximal de deux chaînes de caractères. Il est couramment utilisé en bio-informatique pour aligner des séquences de protéines ou de nucléotides. L'algorithme a été présenté en 1970 par et dans leur article A general method applicable to the search for similarities in the amino acid sequence of two proteins. Les scores pour les caractères alignés sont spécifiés par une matrice de similarité. Ici, est la similarité des caractères i et j. Elle utilise une 'pénalité de trou', appelée ici d. (fr)
  • O algoritmo Needleman–Wunsch tem por objetivo realizar o alinhamento de seqüências global de duas seqüências (denominadas aqui de A e B). Este algoritmo é frequentemente utilizado em Bioinformática para alinhar seqüências de proteínas ou nucleotídeos. O algoritmo foi proposto na década de 1970 por Saul Needleman e Christian Wunsch. Este algoritmo é um exemplo de programação dinâmica e foi a primeira aplicação desta técnica a comparação de sequências biológicas. então o alinhamento: AGACTAGTTAC CGA---GACGT com gap penalty de -5, deveria ter o score: (pt)
  • Алгоритм Нідлмана — Вунша (англ. Needleman–Wunsch algorithm) — один із алгоритмів вирівнювання послідовностей, який належить до динамічного програмування, та є глобальним вирівнюванням. Складається цей алгоритм із трьох послідовних етапів: 1. Побудова ініціюючої матриці 2. Заповнення таблиці Заповнення комірки відбувається за такою математичною формулою: де — значення в певній комірці, — очки за збіжність амінокислоти x та амінокислоти y в певних рядках, d — штаф пенальті (заданий).[2] [Архівовано 13 серпня 2016 у Wayback Machine.] 3. Пошук максимального вирівнювання (uk)
foaf:depiction
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/Needleman-Wunsch_pairwise_sequence_alignment.png
dcterms:subject
Wikipage page ID
Wikipage revision ID
Link from a Wikipage to another Wikipage
Link from a Wikipage to an external page
sameAs
Faceted Search & Find service v1.17_git139 as of Feb 29 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 08.03.3330 as of Mar 19 2024, on Linux (x86_64-generic-linux-glibc212), Single-Server Edition (62 GB total memory, 53 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software